40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2231 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4114  hypothetical protein  89.5 
 
 
382 aa  716    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488486  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2231  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  793    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4383  hypothetical protein  43.93 
 
 
370 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1962  hypothetical protein  44.44 
 
 
370 aa  309  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.555214  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2699  hypothetical protein  33.87 
 
 
361 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2669  hypothetical protein  34.14 
 
 
360 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2714  hypothetical protein  34.14 
 
 
360 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361474  normal  0.0368583 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1532  hypothetical protein  27.56 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3292  hypothetical protein  29.72 
 
 
362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5494  hypothetical protein  27.72 
 
 
369 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542935  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3737  hypothetical protein  28.45 
 
 
357 aa  96.7  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2269  hypothetical protein  25.61 
 
 
355 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3641  hypothetical protein  26.92 
 
 
372 aa  94.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817145  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4073  hypothetical protein  27.25 
 
 
341 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.232287  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3773  hypothetical protein  24.15 
 
 
361 aa  89.7  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0338  hypothetical protein  25.78 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106434  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0353  hypothetical protein  26.37 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760546  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0923  hypothetical protein  25.85 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0308  hypothetical protein  24.43 
 
 
410 aa  70.1  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533164  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3599  hypothetical protein  26.93 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13564  hypothetical protein  24.52 
 
 
375 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000573619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2834  hypothetical protein  24.45 
 
 
385 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4400  hypothetical protein  25.63 
 
 
414 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926858  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2637  hypothetical protein  24.32 
 
 
385 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.836054  normal  0.333709 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3641  hypothetical protein  25.52 
 
 
410 aa  59.7  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5986  hypothetical protein  25.34 
 
 
452 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0465431  normal  0.123001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4371  hypothetical protein  24.36 
 
 
383 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0372  hypothetical protein  25.94 
 
 
412 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3302  hypothetical protein  25.26 
 
 
405 aa  53.9  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4829  hypothetical protein  28.03 
 
 
397 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160841  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4735  hypothetical protein  22.8 
 
 
375 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385545  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4647  hypothetical protein  22.8 
 
 
375 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5030  hypothetical protein  22.8 
 
 
375 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5229  hypothetical protein  22.62 
 
 
387 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.127707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1529  hypothetical protein  21.99 
 
 
375 aa  47  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2496  hypothetical protein  23.03 
 
 
403 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3650  hypothetical protein  28.57 
 
 
428 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1940  hypothetical protein  26.35 
 
 
660 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2756  hypothetical protein  22.89 
 
 
392 aa  43.1  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00358504  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4414  hypothetical protein  29.06 
 
 
653 aa  43.1  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.455569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>