42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3641 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3641  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  842    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3302  hypothetical protein  56.76 
 
 
405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3641  hypothetical protein  32.8 
 
 
372 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817145  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5494  hypothetical protein  31.79 
 
 
369 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542935  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1532  hypothetical protein  32.24 
 
 
370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3292  hypothetical protein  31.22 
 
 
362 aa  162  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3773  hypothetical protein  31.18 
 
 
361 aa  149  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3737  hypothetical protein  28.41 
 
 
357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1875  hypothetical protein  28.25 
 
 
402 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1895  hypothetical protein  27.71 
 
 
402 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1941  hypothetical protein  27.71 
 
 
402 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2496  hypothetical protein  26.36 
 
 
403 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0353  hypothetical protein  29.59 
 
 
390 aa  97.1  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760546  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4073  hypothetical protein  26.05 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.232287  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4400  hypothetical protein  25.19 
 
 
414 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926858  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2269  hypothetical protein  26.05 
 
 
355 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0308  hypothetical protein  27.27 
 
 
410 aa  84.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533164  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0338  hypothetical protein  29.91 
 
 
395 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106434  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2834  hypothetical protein  28.24 
 
 
385 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2637  hypothetical protein  27.78 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.836054  normal  0.333709 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13564  hypothetical protein  27.62 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000573619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3599  hypothetical protein  26.13 
 
 
385 aa  76.3  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5030  hypothetical protein  28.11 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4647  hypothetical protein  28.11 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4735  hypothetical protein  28.11 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385545  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5229  hypothetical protein  26.85 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.127707 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2699  hypothetical protein  26.88 
 
 
361 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4829  hypothetical protein  26.67 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160841  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2756  hypothetical protein  25.54 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00358504  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2669  hypothetical protein  26.88 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2714  hypothetical protein  26.88 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361474  normal  0.0368583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1529  hypothetical protein  25.46 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4114  hypothetical protein  27.62 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488486  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0923  hypothetical protein  22.19 
 
 
403 aa  66.6  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5986  hypothetical protein  24.45 
 
 
452 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0465431  normal  0.123001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4383  hypothetical protein  23.06 
 
 
370 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2231  hypothetical protein  25.52 
 
 
384 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1962  hypothetical protein  25.5 
 
 
370 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.555214  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1940  hypothetical protein  22.52 
 
 
660 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0372  hypothetical protein  24.51 
 
 
412 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4371  hypothetical protein  21.92 
 
 
383 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4414  hypothetical protein  28.41 
 
 
653 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.455569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>