43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0308 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0308  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  826    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1532  hypothetical protein  29.75 
 
 		 370 aa  169  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0338  hypothetical protein  31.1 
 
 		 395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3773  hypothetical protein  27.44 
 
 		 361 aa  131  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5494  hypothetical protein  28.8 
 
 		 369 aa  130  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2637  hypothetical protein  32.91 
 
 		 385 aa  127  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.836054  normal  0.333709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1529  hypothetical protein  32.93 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3737  hypothetical protein  31.06 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3292  hypothetical protein  28.46 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0353  hypothetical protein  31.12 
 
 		 390 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13564  hypothetical protein  33.33 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000573619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3641  hypothetical protein  28.03 
 
 		 372 aa  123  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817145  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5229  hypothetical protein  32.13 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.127707 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4735  hypothetical protein  32.13 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4647  hypothetical protein  32.13 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5030  hypothetical protein  32.13 
 
 		 375 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3599  hypothetical protein  27.7 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2834  hypothetical protein  29.79 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0923  hypothetical protein  33.59 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4829  hypothetical protein  31.33 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2756  hypothetical protein  29.2 
 
 		 392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00358504  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2699  hypothetical protein  26.63 
 
 		 361 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1895  hypothetical protein  26.3 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2669  hypothetical protein  26.63 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1941  hypothetical protein  26.3 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2714  hypothetical protein  26.63 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361474  normal  0.0368583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2496  hypothetical protein  26.42 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1875  hypothetical protein  26.13 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4073  hypothetical protein  29.13 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.232287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4400  hypothetical protein  24.77 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2269  hypothetical protein  26.93 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4371  hypothetical protein  28.84 
 
 		 383 aa  90.5  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3641  hypothetical protein  27.27 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4414  hypothetical protein  35.51 
 
 		 653 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1940  hypothetical protein  34.06 
 
 		 660 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5986  hypothetical protein  35.04 
 
 		 452 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0465431  normal  0.123001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2231  hypothetical protein  25.07 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0372  hypothetical protein  27.67 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4114  hypothetical protein  24.49 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488486  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3650  hypothetical protein  33.79 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4383  hypothetical protein  34.91 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3302  hypothetical protein  26.08 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1962  hypothetical protein  33.02 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.555214  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>