42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2496 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2496  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  826    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1895  hypothetical protein  69.25 
 
 
402 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1941  hypothetical protein  69.25 
 
 
402 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1875  hypothetical protein  69.25 
 
 
402 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4400  hypothetical protein  56.9 
 
 
414 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926858  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1532  hypothetical protein  31.17 
 
 
370 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429844  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5494  hypothetical protein  31.51 
 
 
369 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542935  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3641  hypothetical protein  31.78 
 
 
372 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817145  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3292  hypothetical protein  31.18 
 
 
362 aa  146  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3773  hypothetical protein  27.47 
 
 
361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0338  hypothetical protein  30.2 
 
 
395 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106434  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3737  hypothetical protein  28.38 
 
 
357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3599  hypothetical protein  28.18 
 
 
385 aa  110  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0353  hypothetical protein  28.24 
 
 
390 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760546  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2637  hypothetical protein  28.7 
 
 
385 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.836054  normal  0.333709 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0308  hypothetical protein  26.42 
 
 
410 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533164  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4829  hypothetical protein  26.45 
 
 
397 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160841  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2834  hypothetical protein  28.07 
 
 
385 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3641  hypothetical protein  26.36 
 
 
410 aa  97.8  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0923  hypothetical protein  27.41 
 
 
403 aa  94.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1529  hypothetical protein  24.32 
 
 
375 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2756  hypothetical protein  27.45 
 
 
392 aa  93.2  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00358504  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5229  hypothetical protein  24.59 
 
 
387 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.127707 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13564  hypothetical protein  25.15 
 
 
375 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000573619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2699  hypothetical protein  26.03 
 
 
361 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4735  hypothetical protein  24.87 
 
 
375 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385545  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4647  hypothetical protein  24.87 
 
 
375 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2714  hypothetical protein  26.3 
 
 
360 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361474  normal  0.0368583 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5030  hypothetical protein  24.66 
 
 
375 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2669  hypothetical protein  26.3 
 
 
360 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3650  hypothetical protein  26.73 
 
 
428 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4073  hypothetical protein  26.65 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.232287  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4414  hypothetical protein  27.63 
 
 
653 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4371  hypothetical protein  26.16 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2269  hypothetical protein  25.51 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5986  hypothetical protein  27.47 
 
 
452 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0465431  normal  0.123001 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0372  hypothetical protein  28.1 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1940  hypothetical protein  26.14 
 
 
660 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3302  hypothetical protein  25.25 
 
 
405 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4383  hypothetical protein  26.24 
 
 
370 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4114  hypothetical protein  23.33 
 
 
382 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488486  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2231  hypothetical protein  22.63 
 
 
384 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>