43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4400 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4400  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  852    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926858  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1875  hypothetical protein  57 
 
 
402 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1895  hypothetical protein  56.52 
 
 
402 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1941  hypothetical protein  56.52 
 
 
402 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2496  hypothetical protein  56.9 
 
 
403 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3292  hypothetical protein  32.07 
 
 
362 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5494  hypothetical protein  29.87 
 
 
369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542935  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1532  hypothetical protein  30.19 
 
 
370 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3641  hypothetical protein  28.18 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817145  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0353  hypothetical protein  30.23 
 
 
390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760546  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3773  hypothetical protein  27.65 
 
 
361 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3599  hypothetical protein  28.62 
 
 
385 aa  116  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3737  hypothetical protein  28.76 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0338  hypothetical protein  28.29 
 
 
395 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106434  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4829  hypothetical protein  24.03 
 
 
397 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160841  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0308  hypothetical protein  24.77 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533164  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2756  hypothetical protein  28.61 
 
 
392 aa  97.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00358504  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4414  hypothetical protein  26.54 
 
 
653 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0923  hypothetical protein  26.83 
 
 
403 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2637  hypothetical protein  26.83 
 
 
385 aa  94.4  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.836054  normal  0.333709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2834  hypothetical protein  27.27 
 
 
385 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4647  hypothetical protein  25.71 
 
 
375 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4735  hypothetical protein  25.71 
 
 
375 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385545  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5030  hypothetical protein  25.71 
 
 
375 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13564  hypothetical protein  25.94 
 
 
375 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000573619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5229  hypothetical protein  24.93 
 
 
387 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.127707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1529  hypothetical protein  24.92 
 
 
375 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3641  hypothetical protein  25.19 
 
 
410 aa  86.3  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3650  hypothetical protein  26.69 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2699  hypothetical protein  26.26 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2714  hypothetical protein  26.53 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361474  normal  0.0368583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2669  hypothetical protein  26.53 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5986  hypothetical protein  24.28 
 
 
452 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0465431  normal  0.123001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2269  hypothetical protein  25.5 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4371  hypothetical protein  25.98 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4073  hypothetical protein  26.69 
 
 
341 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.232287  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0372  hypothetical protein  27.13 
 
 
412 aa  67  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3302  hypothetical protein  24.14 
 
 
405 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1940  hypothetical protein  28.26 
 
 
660 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2231  hypothetical protein  25.61 
 
 
384 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4383  hypothetical protein  29.58 
 
 
370 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4114  hypothetical protein  25.33 
 
 
382 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488486  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1962  hypothetical protein  33.33 
 
 
370 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.555214  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>