43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3599 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3599  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  788    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1529  hypothetical protein  70.54 
 
 
375 aa  549  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5229  hypothetical protein  70.03 
 
 
387 aa  544  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.127707 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4647  hypothetical protein  70.03 
 
 
375 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4735  hypothetical protein  70.03 
 
 
375 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385545  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5030  hypothetical protein  69.77 
 
 
375 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13564  hypothetical protein  67.96 
 
 
375 aa  532  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000573619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4829  hypothetical protein  63.82 
 
 
397 aa  495  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160841  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2756  hypothetical protein  54.71 
 
 
392 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00358504  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2834  hypothetical protein  57.34 
 
 
385 aa  425  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2637  hypothetical protein  57.3 
 
 
385 aa  425  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.836054  normal  0.333709 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0923  hypothetical protein  57.36 
 
 
403 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4371  hypothetical protein  44.53 
 
 
383 aa  317  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3292  hypothetical protein  30.2 
 
 
362 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5494  hypothetical protein  32.93 
 
 
369 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542935  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1532  hypothetical protein  30.5 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429844  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5986  hypothetical protein  32.49 
 
 
452 aa  132  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0465431  normal  0.123001 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0372  hypothetical protein  31.51 
 
 
412 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0308  hypothetical protein  27.41 
 
 
410 aa  119  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533164  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4414  hypothetical protein  28.57 
 
 
653 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3773  hypothetical protein  26.15 
 
 
361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4400  hypothetical protein  28.62 
 
 
414 aa  117  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926858  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3641  hypothetical protein  27.51 
 
 
372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817145  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3650  hypothetical protein  30.51 
 
 
428 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0353  hypothetical protein  30.16 
 
 
390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760546  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2496  hypothetical protein  28.18 
 
 
403 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3737  hypothetical protein  28.65 
 
 
357 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1940  hypothetical protein  27.98 
 
 
660 aa  106  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2699  hypothetical protein  28.1 
 
 
361 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1875  hypothetical protein  26.42 
 
 
402 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1941  hypothetical protein  26.14 
 
 
402 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1895  hypothetical protein  26.14 
 
 
402 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2714  hypothetical protein  28.77 
 
 
360 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361474  normal  0.0368583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2669  hypothetical protein  28.77 
 
 
360 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0338  hypothetical protein  29.22 
 
 
395 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106434  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2269  hypothetical protein  26.63 
 
 
355 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4073  hypothetical protein  25.71 
 
 
341 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.232287  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4114  hypothetical protein  27.05 
 
 
382 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488486  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3641  hypothetical protein  26.13 
 
 
410 aa  76.3  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2231  hypothetical protein  26.93 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3302  hypothetical protein  25.66 
 
 
405 aa  66.2  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4383  hypothetical protein  24.85 
 
 
370 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1962  hypothetical protein  23.16 
 
 
370 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.555214  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>