53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4414 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4414  hypothetical protein  100 
 
 
653 aa  1304    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1940  hypothetical protein  62.04 
 
 
660 aa  771    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5986  hypothetical protein  35.82 
 
 
452 aa  239  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0465431  normal  0.123001 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0372  hypothetical protein  30.64 
 
 
412 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2637  hypothetical protein  31.42 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.836054  normal  0.333709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2834  hypothetical protein  31.72 
 
 
385 aa  127  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0923  hypothetical protein  28.99 
 
 
403 aa  121  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3650  hypothetical protein  29.9 
 
 
428 aa  118  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3599  hypothetical protein  28.57 
 
 
385 aa  117  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4647  hypothetical protein  28.99 
 
 
375 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4735  hypothetical protein  28.99 
 
 
375 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385545  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5030  hypothetical protein  28.99 
 
 
375 aa  105  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1529  hypothetical protein  28.57 
 
 
375 aa  103  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13564  hypothetical protein  27.79 
 
 
375 aa  101  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000573619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0338  hypothetical protein  27.07 
 
 
395 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106434  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5229  hypothetical protein  28.49 
 
 
387 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.127707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4400  hypothetical protein  26.54 
 
 
414 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926858  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2756  hypothetical protein  26.63 
 
 
392 aa  92  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00358504  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4829  hypothetical protein  27.73 
 
 
397 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160841  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1532  hypothetical protein  26.96 
 
 
370 aa  87.8  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429844  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1875  hypothetical protein  27.04 
 
 
402 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4371  hypothetical protein  36.71 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0353  hypothetical protein  24.49 
 
 
390 aa  83.2  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760546  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1941  hypothetical protein  26.38 
 
 
402 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1895  hypothetical protein  26.38 
 
 
402 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3292  hypothetical protein  24.62 
 
 
362 aa  80.1  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0308  hypothetical protein  35.51 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533164  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2496  hypothetical protein  27.63 
 
 
403 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4073  hypothetical protein  26.06 
 
 
341 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.232287  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5494  hypothetical protein  25.62 
 
 
369 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542935  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3773  hypothetical protein  25.08 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4077  peptidase S15  34.87 
 
 
854 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122952  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3641  hypothetical protein  24.56 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817145  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2269  hypothetical protein  32 
 
 
355 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2669  hypothetical protein  36.9 
 
 
360 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2714  hypothetical protein  36.9 
 
 
360 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361474  normal  0.0368583 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2699  hypothetical protein  36.9 
 
 
361 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3737  hypothetical protein  21.63 
 
 
357 aa  59.3  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1041  peptidase S15  39.39 
 
 
778 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  44.94 
 
 
934 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3641  hypothetical protein  28.41 
 
 
410 aa  50.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1067  peptidase S15  40.54 
 
 
775 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  36.72 
 
 
2310 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  53.7 
 
 
999 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  53.7 
 
 
999 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  31.88 
 
 
2305 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  53.7 
 
 
999 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1994  hypothetical protein  37.86 
 
 
746 aa  44.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  31.43 
 
 
3378 aa  44.3  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5243  hypothetical protein  46.05 
 
 
693 aa  44.3  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.751292  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4994  hypothetical protein  39.73 
 
 
557 aa  43.9  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449903  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5004  hypothetical protein  32.04 
 
 
1039 aa  43.9  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5180  hypothetical protein  42.86 
 
 
692 aa  43.9  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.357825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>