43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2669 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2669  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  728    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2714  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  728    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361474  normal  0.0368583 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2699  hypothetical protein  99.45 
 
 
361 aa  699    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1962  hypothetical protein  37.94 
 
 
370 aa  235  7e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.555214  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4383  hypothetical protein  35.95 
 
 
370 aa  228  9e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4114  hypothetical protein  34.59 
 
 
382 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488486  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2231  hypothetical protein  35.69 
 
 
384 aa  215  8e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3773  hypothetical protein  30.66 
 
 
361 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3292  hypothetical protein  30.97 
 
 
362 aa  143  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3641  hypothetical protein  30.08 
 
 
372 aa  142  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817145  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0338  hypothetical protein  32.56 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106434  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5494  hypothetical protein  28.57 
 
 
369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542935  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2269  hypothetical protein  28.88 
 
 
355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1532  hypothetical protein  27.61 
 
 
370 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429844  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4073  hypothetical protein  30.09 
 
 
341 aa  122  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.232287  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3737  hypothetical protein  30.97 
 
 
357 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5229  hypothetical protein  28.99 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.127707 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4647  hypothetical protein  28.45 
 
 
375 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4735  hypothetical protein  28.45 
 
 
375 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385545  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5030  hypothetical protein  28.45 
 
 
375 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4371  hypothetical protein  29.3 
 
 
383 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0923  hypothetical protein  28.4 
 
 
403 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0308  hypothetical protein  26.89 
 
 
410 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533164  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3599  hypothetical protein  28.53 
 
 
385 aa  105  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13564  hypothetical protein  28.36 
 
 
375 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000573619 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1529  hypothetical protein  28.35 
 
 
375 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0353  hypothetical protein  29.64 
 
 
390 aa  99.8  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760546  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4829  hypothetical protein  28.27 
 
 
397 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160841  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2834  hypothetical protein  27.06 
 
 
385 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2637  hypothetical protein  27.71 
 
 
385 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.836054  normal  0.333709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2496  hypothetical protein  26.3 
 
 
403 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2756  hypothetical protein  24.85 
 
 
392 aa  86.3  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00358504  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4400  hypothetical protein  26.79 
 
 
414 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926858  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3641  hypothetical protein  27.45 
 
 
410 aa  76.3  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1875  hypothetical protein  26.63 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1941  hypothetical protein  26.36 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1895  hypothetical protein  26.36 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3650  hypothetical protein  26.46 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3302  hypothetical protein  26.13 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0372  hypothetical protein  27.83 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5986  hypothetical protein  23.99 
 
 
452 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0465431  normal  0.123001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4414  hypothetical protein  34.51 
 
 
653 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1940  hypothetical protein  24.22 
 
 
660 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>