42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4371 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4371  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  785    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2756  hypothetical protein  50.13 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00358504  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2834  hypothetical protein  51.28 
 
 		 385 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2637  hypothetical protein  49.87 
 
 		 385 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.836054  normal  0.333709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4647  hypothetical protein  49.08 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4735  hypothetical protein  49.08 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5030  hypothetical protein  48.82 
 
 		 375 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5229  hypothetical protein  46.98 
 
 		 387 aa  355  5e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.127707 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4829  hypothetical protein  47.87 
 
 		 397 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1529  hypothetical protein  47.24 
 
 		 375 aa  352  7e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13564  hypothetical protein  47.63 
 
 		 375 aa  350  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000573619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0923  hypothetical protein  47.97 
 
 		 403 aa  338  9.999999999999999e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3599  hypothetical protein  44.24 
 
 		 385 aa  299  6e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3292  hypothetical protein  29.03 
 
 		 362 aa  142  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1532  hypothetical protein  32.27 
 
 		 370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429844  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5494  hypothetical protein  32.48 
 
 		 369 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3641  hypothetical protein  29.24 
 
 		 372 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817145  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0338  hypothetical protein  28.35 
 
 		 395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3650  hypothetical protein  28.02 
 
 		 428 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5986  hypothetical protein  28.74 
 
 		 452 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0465431  normal  0.123001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2699  hypothetical protein  28.8 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2669  hypothetical protein  29.3 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2714  hypothetical protein  29.3 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361474  normal  0.0368583 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1940  hypothetical protein  27.34 
 
 		 660 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3773  hypothetical protein  26.69 
 
 		 361 aa  102  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0372  hypothetical protein  30.5 
 
 		 412 aa  97.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0308  hypothetical protein  28.84 
 
 		 410 aa  90.5  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3737  hypothetical protein  25.49 
 
 		 357 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4414  hypothetical protein  36.71 
 
 		 653 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4073  hypothetical protein  28.75 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.232287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2269  hypothetical protein  26.09 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0353  hypothetical protein  28.16 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2496  hypothetical protein  26.16 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4400  hypothetical protein  25.98 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1875  hypothetical protein  23.58 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4114  hypothetical protein  24.48 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488486  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1941  hypothetical protein  23.31 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1895  hypothetical protein  23.31 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2231  hypothetical protein  23.26 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4383  hypothetical protein  23.1 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3641  hypothetical protein  21.92 
 
 		 410 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1962  hypothetical protein  21.99 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.555214  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>