42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2637 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2637  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  783    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.836054  normal  0.333709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2834  hypothetical protein  88.83 
 
 
385 aa  677    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2756  hypothetical protein  68.11 
 
 
392 aa  543  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00358504  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13564  hypothetical protein  55.81 
 
 
375 aa  432  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000573619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0923  hypothetical protein  57.99 
 
 
403 aa  425  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4829  hypothetical protein  55.81 
 
 
397 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160841  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5229  hypothetical protein  54.26 
 
 
387 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.127707 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4735  hypothetical protein  54.52 
 
 
375 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385545  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5030  hypothetical protein  54.52 
 
 
375 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1529  hypothetical protein  53.49 
 
 
375 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4647  hypothetical protein  54.52 
 
 
375 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3599  hypothetical protein  56.19 
 
 
385 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4371  hypothetical protein  50.51 
 
 
383 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3292  hypothetical protein  34.56 
 
 
362 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1532  hypothetical protein  32.12 
 
 
370 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3641  hypothetical protein  30.06 
 
 
372 aa  145  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817145  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5494  hypothetical protein  33.33 
 
 
369 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542935  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4414  hypothetical protein  31.42 
 
 
653 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3773  hypothetical protein  27.46 
 
 
361 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0308  hypothetical protein  32.91 
 
 
410 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533164  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3650  hypothetical protein  31.33 
 
 
428 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5986  hypothetical protein  30.26 
 
 
452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0465431  normal  0.123001 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0338  hypothetical protein  31.34 
 
 
395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106434  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3737  hypothetical protein  28.44 
 
 
357 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0372  hypothetical protein  31.17 
 
 
412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1940  hypothetical protein  28.49 
 
 
660 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0353  hypothetical protein  31.33 
 
 
390 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760546  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2496  hypothetical protein  29.72 
 
 
403 aa  106  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1875  hypothetical protein  27.33 
 
 
402 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4073  hypothetical protein  27.41 
 
 
341 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.232287  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4400  hypothetical protein  26.83 
 
 
414 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926858  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2269  hypothetical protein  27.13 
 
 
355 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1941  hypothetical protein  26.83 
 
 
402 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1895  hypothetical protein  26.83 
 
 
402 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2699  hypothetical protein  26.35 
 
 
361 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2714  hypothetical protein  26.67 
 
 
360 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361474  normal  0.0368583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2669  hypothetical protein  26.67 
 
 
360 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3641  hypothetical protein  27.78 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4114  hypothetical protein  25.63 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488486  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2231  hypothetical protein  24.32 
 
 
384 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3302  hypothetical protein  24.92 
 
 
405 aa  53.9  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4383  hypothetical protein  22.41 
 
 
370 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>