43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5229 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1529  hypothetical protein  93.6 
 
 
375 aa  733    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4647  hypothetical protein  92.27 
 
 
375 aa  724    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5030  hypothetical protein  92 
 
 
375 aa  721    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5229  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  797    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.127707 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4735  hypothetical protein  92.27 
 
 
375 aa  724    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385545  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13564  hypothetical protein  78.93 
 
 
375 aa  629  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000573619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4829  hypothetical protein  71.73 
 
 
397 aa  580  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160841  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3599  hypothetical protein  70.03 
 
 
385 aa  521  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2756  hypothetical protein  54.85 
 
 
392 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00358504  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0923  hypothetical protein  55.67 
 
 
403 aa  419  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2834  hypothetical protein  52.97 
 
 
385 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2637  hypothetical protein  55.4 
 
 
385 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.836054  normal  0.333709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4371  hypothetical protein  46.98 
 
 
383 aa  355  5e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3292  hypothetical protein  29.17 
 
 
362 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0308  hypothetical protein  32.13 
 
 
410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533164  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3773  hypothetical protein  26.27 
 
 
361 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2699  hypothetical protein  28.27 
 
 
361 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3641  hypothetical protein  29.22 
 
 
372 aa  113  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817145  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1532  hypothetical protein  27.62 
 
 
370 aa  113  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429844  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5986  hypothetical protein  31.73 
 
 
452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0465431  normal  0.123001 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2714  hypothetical protein  28.53 
 
 
360 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361474  normal  0.0368583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2669  hypothetical protein  28.53 
 
 
360 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5494  hypothetical protein  29.07 
 
 
369 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542935  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0372  hypothetical protein  32.98 
 
 
412 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0338  hypothetical protein  28.9 
 
 
395 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106434  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0353  hypothetical protein  28.15 
 
 
390 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760546  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3650  hypothetical protein  28.78 
 
 
428 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1940  hypothetical protein  28.49 
 
 
660 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4414  hypothetical protein  28.49 
 
 
653 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2496  hypothetical protein  24.59 
 
 
403 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1875  hypothetical protein  25.72 
 
 
402 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1941  hypothetical protein  25.46 
 
 
402 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1895  hypothetical protein  25.46 
 
 
402 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3737  hypothetical protein  24.79 
 
 
357 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2269  hypothetical protein  23.82 
 
 
355 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4400  hypothetical protein  24.93 
 
 
414 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926858  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4073  hypothetical protein  23.84 
 
 
341 aa  87  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.232287  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3641  hypothetical protein  26.85 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3302  hypothetical protein  29.02 
 
 
405 aa  60.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1962  hypothetical protein  24.64 
 
 
370 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.555214  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4383  hypothetical protein  26.32 
 
 
370 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4114  hypothetical protein  23.45 
 
 
382 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488486  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2231  hypothetical protein  22.62 
 
 
384 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>