43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0353 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0353  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  801    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0338  hypothetical protein  33.08 
 
 		 395 aa  185  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3641  hypothetical protein  27.84 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817145  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5494  hypothetical protein  30.27 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4400  hypothetical protein  30.33 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0308  hypothetical protein  31.03 
 
 		 410 aa  133  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1532  hypothetical protein  28.3 
 
 		 370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3292  hypothetical protein  32.38 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3773  hypothetical protein  28.45 
 
 		 361 aa  129  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1875  hypothetical protein  30.25 
 
 		 402 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0923  hypothetical protein  30.86 
 
 		 403 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1941  hypothetical protein  30.02 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1895  hypothetical protein  30.02 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3737  hypothetical protein  28.17 
 
 		 357 aa  115  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2496  hypothetical protein  28.39 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4735  hypothetical protein  31 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4647  hypothetical protein  31 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5030  hypothetical protein  30.75 
 
 		 375 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3599  hypothetical protein  28.87 
 
 		 385 aa  109  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4073  hypothetical protein  28.62 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.232287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2637  hypothetical protein  31.33 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.836054  normal  0.333709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1529  hypothetical protein  28.08 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5229  hypothetical protein  28.33 
 
 		 387 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.127707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2834  hypothetical protein  29.78 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4829  hypothetical protein  27.96 
 
 		 397 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2269  hypothetical protein  26.28 
 
 		 355 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2699  hypothetical protein  28.99 
 
 		 361 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3641  hypothetical protein  29.59 
 
 		 410 aa  97.1  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2756  hypothetical protein  26.95 
 
 		 392 aa  96.3  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00358504  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2669  hypothetical protein  29.32 
 
 		 360 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2714  hypothetical protein  29.32 
 
 		 360 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361474  normal  0.0368583 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13564  hypothetical protein  28.71 
 
 		 375 aa  94  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000573619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0372  hypothetical protein  29.6 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4414  hypothetical protein  24.46 
 
 		 653 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1940  hypothetical protein  25.42 
 
 		 660 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5986  hypothetical protein  28.25 
 
 		 452 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0465431  normal  0.123001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2231  hypothetical protein  26.37 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4371  hypothetical protein  27.78 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3302  hypothetical protein  26.26 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4114  hypothetical protein  25.5 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488486  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4383  hypothetical protein  26.86 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3650  hypothetical protein  27.06 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1962  hypothetical protein  27.54 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.555214  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>