39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4383 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4383  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  754    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1962  hypothetical protein  86.49 
 
 
370 aa  640    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.555214  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4114  hypothetical protein  43.86 
 
 
382 aa  316  4e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488486  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2231  hypothetical protein  44.15 
 
 
384 aa  315  6e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2699  hypothetical protein  35.95 
 
 
361 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2669  hypothetical protein  35.95 
 
 
360 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2714  hypothetical protein  35.95 
 
 
360 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361474  normal  0.0368583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4073  hypothetical protein  28.33 
 
 
341 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.232287  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0338  hypothetical protein  27.37 
 
 
395 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106434  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1532  hypothetical protein  26.79 
 
 
370 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429844  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5494  hypothetical protein  25.48 
 
 
369 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542935  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3292  hypothetical protein  26.01 
 
 
362 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2269  hypothetical protein  24.78 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3641  hypothetical protein  25.78 
 
 
372 aa  79.3  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817145  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0353  hypothetical protein  26.8 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760546  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3773  hypothetical protein  26.75 
 
 
361 aa  69.3  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0308  hypothetical protein  25.31 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533164  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3737  hypothetical protein  24.36 
 
 
357 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3641  hypothetical protein  23.06 
 
 
410 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1875  hypothetical protein  25.98 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4647  hypothetical protein  26.1 
 
 
375 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4400  hypothetical protein  25.71 
 
 
414 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926858  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4735  hypothetical protein  26.1 
 
 
375 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385545  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5030  hypothetical protein  26.1 
 
 
375 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1895  hypothetical protein  25.79 
 
 
402 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3599  hypothetical protein  25.15 
 
 
385 aa  60.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1941  hypothetical protein  25.79 
 
 
402 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0923  hypothetical protein  22.65 
 
 
403 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4371  hypothetical protein  23.63 
 
 
383 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5229  hypothetical protein  26.11 
 
 
387 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.127707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2496  hypothetical protein  26.57 
 
 
403 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2834  hypothetical protein  22.99 
 
 
385 aa  56.2  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1529  hypothetical protein  25.44 
 
 
375 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13564  hypothetical protein  24.83 
 
 
375 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000573619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3650  hypothetical protein  26.57 
 
 
428 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2637  hypothetical protein  22.7 
 
 
385 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.836054  normal  0.333709 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3302  hypothetical protein  23.94 
 
 
405 aa  47  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1940  hypothetical protein  32.22 
 
 
660 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5986  hypothetical protein  25.07 
 
 
452 aa  42.7  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0465431  normal  0.123001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>