43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3292 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3292  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  748    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3641  hypothetical protein  53.48 
 
 		 372 aa  388  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817145  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3773  hypothetical protein  53.58 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1532  hypothetical protein  50.85 
 
 		 370 aa  361  9e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429844  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5494  hypothetical protein  51.99 
 
 		 369 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3737  hypothetical protein  51 
 
 		 357 aa  343  4e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2637  hypothetical protein  34.56 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.836054  normal  0.333709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2834  hypothetical protein  33.81 
 
 		 385 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0338  hypothetical protein  33.51 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3641  hypothetical protein  31.22 
 
 		 410 aa  162  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3302  hypothetical protein  33.51 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2756  hypothetical protein  32.94 
 
 		 392 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00358504  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4400  hypothetical protein  32.07 
 
 		 414 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13564  hypothetical protein  31.61 
 
 		 375 aa  150  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000573619 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2496  hypothetical protein  31.18 
 
 		 403 aa  146  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1941  hypothetical protein  29.97 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1895  hypothetical protein  29.97 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1875  hypothetical protein  29.97 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2699  hypothetical protein  29.46 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4371  hypothetical protein  29.03 
 
 		 383 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3599  hypothetical protein  30.63 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2669  hypothetical protein  29.72 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2714  hypothetical protein  29.72 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361474  normal  0.0368583 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4829  hypothetical protein  30.15 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4073  hypothetical protein  32.21 
 
 		 341 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.232287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2269  hypothetical protein  31.52 
 
 		 355 aa  136  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0923  hypothetical protein  28.92 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5229  hypothetical protein  29.17 
 
 		 387 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.127707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0353  hypothetical protein  32.38 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4647  hypothetical protein  28.66 
 
 		 375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4735  hypothetical protein  28.66 
 
 		 375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5030  hypothetical protein  28.66 
 
 		 375 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1529  hypothetical protein  27.67 
 
 		 375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0308  hypothetical protein  28.46 
 
 		 410 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2231  hypothetical protein  29.72 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4114  hypothetical protein  27.78 
 
 		 382 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488486  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0372  hypothetical protein  29.35 
 
 		 412 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4383  hypothetical protein  26.01 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4414  hypothetical protein  24.62 
 
 		 653 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3650  hypothetical protein  26.74 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1940  hypothetical protein  24.68 
 
 		 660 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1962  hypothetical protein  26.71 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.555214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5986  hypothetical protein  25 
 
 		 452 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0465431  normal  0.123001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>