42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2756 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2756  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  804    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00358504  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2834  hypothetical protein  69.39 
 
 
385 aa  545  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2637  hypothetical protein  68.62 
 
 
385 aa  536  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.836054  normal  0.333709 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13564  hypothetical protein  57.4 
 
 
375 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000573619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5229  hypothetical protein  55.1 
 
 
387 aa  450  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.127707 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4829  hypothetical protein  56.78 
 
 
397 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160841  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1529  hypothetical protein  54.85 
 
 
375 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4647  hypothetical protein  55.36 
 
 
375 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4735  hypothetical protein  55.36 
 
 
375 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385545  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5030  hypothetical protein  55.1 
 
 
375 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0923  hypothetical protein  58.11 
 
 
403 aa  441  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3599  hypothetical protein  56.18 
 
 
385 aa  431  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4371  hypothetical protein  50.13 
 
 
383 aa  388  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3292  hypothetical protein  32.44 
 
 
362 aa  162  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1532  hypothetical protein  32.8 
 
 
370 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3641  hypothetical protein  30.86 
 
 
372 aa  139  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817145  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5494  hypothetical protein  32.06 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542935  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3650  hypothetical protein  32.46 
 
 
428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0372  hypothetical protein  31.17 
 
 
412 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3773  hypothetical protein  27.09 
 
 
361 aa  124  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0308  hypothetical protein  29.86 
 
 
410 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533164  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5986  hypothetical protein  28.66 
 
 
452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0465431  normal  0.123001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2269  hypothetical protein  26.33 
 
 
355 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3737  hypothetical protein  27.57 
 
 
357 aa  107  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4073  hypothetical protein  27.27 
 
 
341 aa  106  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.232287  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4400  hypothetical protein  28.87 
 
 
414 aa  106  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926858  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0338  hypothetical protein  27.57 
 
 
395 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106434  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2496  hypothetical protein  27.38 
 
 
403 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0353  hypothetical protein  27.06 
 
 
390 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760546  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4414  hypothetical protein  27.81 
 
 
653 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2699  hypothetical protein  25.45 
 
 
361 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1875  hypothetical protein  28.05 
 
 
402 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2714  hypothetical protein  25.76 
 
 
360 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361474  normal  0.0368583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2669  hypothetical protein  25.76 
 
 
360 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1941  hypothetical protein  26.82 
 
 
402 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1895  hypothetical protein  26.82 
 
 
402 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1940  hypothetical protein  31.82 
 
 
660 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3641  hypothetical protein  25.54 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4114  hypothetical protein  23.59 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488486  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3302  hypothetical protein  23.47 
 
 
405 aa  57  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2231  hypothetical protein  23.37 
 
 
384 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4383  hypothetical protein  21.92 
 
 
370 aa  43.9  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>