41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1941 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1895  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  820    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1941  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  820    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1875  hypothetical protein  99.25 
 
 
402 aa  813    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2496  hypothetical protein  69.25 
 
 
403 aa  570  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4400  hypothetical protein  56.52 
 
 
414 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926858  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1532  hypothetical protein  30.16 
 
 
370 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429844  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5494  hypothetical protein  29.59 
 
 
369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542935  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3292  hypothetical protein  29.97 
 
 
362 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3641  hypothetical protein  28.06 
 
 
372 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817145  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0338  hypothetical protein  29.09 
 
 
395 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106434  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3773  hypothetical protein  26.32 
 
 
361 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3737  hypothetical protein  29.48 
 
 
357 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0353  hypothetical protein  30.15 
 
 
390 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760546  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0308  hypothetical protein  26.3 
 
 
410 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533164  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3599  hypothetical protein  26.14 
 
 
385 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4829  hypothetical protein  26.04 
 
 
397 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160841  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3641  hypothetical protein  27.71 
 
 
410 aa  101  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3650  hypothetical protein  29.22 
 
 
428 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2637  hypothetical protein  26.83 
 
 
385 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.836054  normal  0.333709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2834  hypothetical protein  29.43 
 
 
385 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5229  hypothetical protein  25.46 
 
 
387 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.127707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1529  hypothetical protein  24.93 
 
 
375 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5030  hypothetical protein  24.23 
 
 
375 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4735  hypothetical protein  23.98 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385545  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4647  hypothetical protein  23.98 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4414  hypothetical protein  26.38 
 
 
653 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13564  hypothetical protein  24.35 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000573619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2269  hypothetical protein  25.23 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2699  hypothetical protein  26.36 
 
 
361 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0923  hypothetical protein  24.76 
 
 
403 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2756  hypothetical protein  26.26 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00358504  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2714  hypothetical protein  26.36 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361474  normal  0.0368583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2669  hypothetical protein  26.36 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3302  hypothetical protein  27 
 
 
405 aa  71.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5986  hypothetical protein  26.47 
 
 
452 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0465431  normal  0.123001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4371  hypothetical protein  23.31 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4073  hypothetical protein  24.23 
 
 
341 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.232287  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1940  hypothetical protein  24.52 
 
 
660 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0372  hypothetical protein  27.17 
 
 
412 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4383  hypothetical protein  25.58 
 
 
370 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1962  hypothetical protein  28.3 
 
 
370 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.555214  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>