43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3773 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3773  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  750    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3292  hypothetical protein  53.58 
 
 
362 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3641  hypothetical protein  46.26 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817145  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3737  hypothetical protein  45.56 
 
 
357 aa  320  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1532  hypothetical protein  43.87 
 
 
370 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429844  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5494  hypothetical protein  42.94 
 
 
369 aa  289  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542935  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3641  hypothetical protein  31.18 
 
 
410 aa  149  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0338  hypothetical protein  30.7 
 
 
395 aa  149  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106434  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2699  hypothetical protein  30.75 
 
 
361 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2714  hypothetical protein  31.02 
 
 
360 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361474  normal  0.0368583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2669  hypothetical protein  31.02 
 
 
360 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0308  hypothetical protein  27.44 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533164  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2496  hypothetical protein  27.47 
 
 
403 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2637  hypothetical protein  27.46 
 
 
385 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.836054  normal  0.333709 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0353  hypothetical protein  28.45 
 
 
390 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760546  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13564  hypothetical protein  27.19 
 
 
375 aa  126  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000573619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2269  hypothetical protein  28.75 
 
 
355 aa  126  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2834  hypothetical protein  26.87 
 
 
385 aa  125  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1941  hypothetical protein  26.32 
 
 
402 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1895  hypothetical protein  26.32 
 
 
402 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1875  hypothetical protein  26.32 
 
 
402 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3302  hypothetical protein  29.85 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4400  hypothetical protein  27.65 
 
 
414 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926858  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2756  hypothetical protein  26.22 
 
 
392 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00358504  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5229  hypothetical protein  26.27 
 
 
387 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.127707 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5030  hypothetical protein  25.97 
 
 
375 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4647  hypothetical protein  25.97 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4735  hypothetical protein  25.97 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385545  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3599  hypothetical protein  26.69 
 
 
385 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4829  hypothetical protein  25.37 
 
 
397 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160841  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1529  hypothetical protein  25.14 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4073  hypothetical protein  26.97 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.232287  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0923  hypothetical protein  24.38 
 
 
403 aa  102  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4371  hypothetical protein  26.69 
 
 
383 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2231  hypothetical protein  25 
 
 
384 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4114  hypothetical protein  24.93 
 
 
382 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488486  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0372  hypothetical protein  24.13 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4414  hypothetical protein  25.47 
 
 
653 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5986  hypothetical protein  25.64 
 
 
452 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0465431  normal  0.123001 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3650  hypothetical protein  24.44 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4383  hypothetical protein  26.75 
 
 
370 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1940  hypothetical protein  24.45 
 
 
660 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1962  hypothetical protein  25.83 
 
 
370 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.555214  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>