39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4114 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4114  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  784    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488486  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2231  hypothetical protein  89.81 
 
 
384 aa  706    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4383  hypothetical protein  43.86 
 
 
370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1962  hypothetical protein  44.91 
 
 
370 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.555214  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2699  hypothetical protein  34.23 
 
 
361 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2669  hypothetical protein  34.5 
 
 
360 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2714  hypothetical protein  34.5 
 
 
360 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361474  normal  0.0368583 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1532  hypothetical protein  26.68 
 
 
370 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3292  hypothetical protein  27.78 
 
 
362 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5494  hypothetical protein  27.68 
 
 
369 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542935  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2269  hypothetical protein  26.16 
 
 
355 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3641  hypothetical protein  26.33 
 
 
372 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817145  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3737  hypothetical protein  28.23 
 
 
357 aa  92.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4073  hypothetical protein  25.87 
 
 
341 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.232287  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3773  hypothetical protein  24.93 
 
 
361 aa  84  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0338  hypothetical protein  25.19 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106434  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3599  hypothetical protein  26.54 
 
 
385 aa  76.3  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0353  hypothetical protein  25.5 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760546  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0923  hypothetical protein  26.55 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4371  hypothetical protein  24.48 
 
 
383 aa  69.7  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0308  hypothetical protein  24.49 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533164  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5986  hypothetical protein  27.4 
 
 
452 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0465431  normal  0.123001 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3641  hypothetical protein  27.62 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2637  hypothetical protein  25.63 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.836054  normal  0.333709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2834  hypothetical protein  24.07 
 
 
385 aa  66.2  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13564  hypothetical protein  24.87 
 
 
375 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000573619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0372  hypothetical protein  25.8 
 
 
412 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4400  hypothetical protein  25.33 
 
 
414 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926858  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4829  hypothetical protein  28.18 
 
 
397 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160841  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3302  hypothetical protein  24.07 
 
 
405 aa  53.5  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5229  hypothetical protein  23.45 
 
 
387 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.127707 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4647  hypothetical protein  23.14 
 
 
375 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4735  hypothetical protein  23.14 
 
 
375 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385545  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5030  hypothetical protein  23.46 
 
 
375 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2756  hypothetical protein  23.32 
 
 
392 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00358504  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2496  hypothetical protein  23.33 
 
 
403 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1529  hypothetical protein  22.52 
 
 
375 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3650  hypothetical protein  27.38 
 
 
428 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4414  hypothetical protein  29.06 
 
 
653 aa  43.5  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.455569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>