43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3650 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3650  hypothetical protein  100 
 
 
428 aa  863    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0413  hypothetical protein  59.22 
 
 
168 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.343112  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5986  hypothetical protein  29.21 
 
 
452 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0465431  normal  0.123001 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2637  hypothetical protein  31.33 
 
 
385 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.836054  normal  0.333709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2756  hypothetical protein  31.3 
 
 
392 aa  123  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00358504  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4414  hypothetical protein  29.9 
 
 
653 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0372  hypothetical protein  29.2 
 
 
412 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2834  hypothetical protein  29.76 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0923  hypothetical protein  29.55 
 
 
403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13564  hypothetical protein  32.6 
 
 
375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000573619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3599  hypothetical protein  27.99 
 
 
385 aa  113  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4371  hypothetical protein  28.02 
 
 
383 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1940  hypothetical protein  28.35 
 
 
660 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4829  hypothetical protein  28.68 
 
 
397 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160841  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4735  hypothetical protein  30.26 
 
 
375 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385545  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4647  hypothetical protein  30.26 
 
 
375 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5030  hypothetical protein  30.26 
 
 
375 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5229  hypothetical protein  28.78 
 
 
387 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.127707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1529  hypothetical protein  27.44 
 
 
375 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1875  hypothetical protein  29.04 
 
 
402 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1895  hypothetical protein  29.22 
 
 
402 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1941  hypothetical protein  29.22 
 
 
402 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0338  hypothetical protein  27.46 
 
 
395 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106434  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2496  hypothetical protein  26.73 
 
 
403 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4400  hypothetical protein  26.69 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926858  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3292  hypothetical protein  26.74 
 
 
362 aa  80.5  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1532  hypothetical protein  26.58 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429844  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5494  hypothetical protein  25.89 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542935  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2699  hypothetical protein  25.08 
 
 
361 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3773  hypothetical protein  24.44 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0308  hypothetical protein  33.79 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533164  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3641  hypothetical protein  23 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817145  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2714  hypothetical protein  25.38 
 
 
360 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361474  normal  0.0368583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2669  hypothetical protein  25.38 
 
 
360 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3737  hypothetical protein  25.94 
 
 
357 aa  66.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0353  hypothetical protein  28.17 
 
 
390 aa  63.2  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760546  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0412  hypothetical protein  55 
 
 
44 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120533  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4383  hypothetical protein  25.61 
 
 
370 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4073  hypothetical protein  21.89 
 
 
341 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.232287  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2269  hypothetical protein  23.43 
 
 
355 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1962  hypothetical protein  26.3 
 
 
370 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.555214  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2231  hypothetical protein  28.57 
 
 
384 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4114  hypothetical protein  27.38 
 
 
382 aa  43.5  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488486  normal  0.812422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>