42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13564 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13564  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  773    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000573619 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4647  hypothetical protein  80 
 
 
375 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5229  hypothetical protein  78.93 
 
 
387 aa  629  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.127707 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4735  hypothetical protein  80 
 
 
375 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385545  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5030  hypothetical protein  79.73 
 
 
375 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1529  hypothetical protein  77.87 
 
 
375 aa  622  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4829  hypothetical protein  72.8 
 
 
397 aa  587  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160841  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3599  hypothetical protein  67.96 
 
 
385 aa  510  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2756  hypothetical protein  57.14 
 
 
392 aa  463  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00358504  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2834  hypothetical protein  55.56 
 
 
385 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2637  hypothetical protein  55.81 
 
 
385 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.836054  normal  0.333709 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0923  hypothetical protein  54.64 
 
 
403 aa  413  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4371  hypothetical protein  47.63 
 
 
383 aa  350  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3292  hypothetical protein  31.61 
 
 
362 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3773  hypothetical protein  27.19 
 
 
361 aa  126  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0308  hypothetical protein  33.33 
 
 
410 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533164  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3641  hypothetical protein  28.88 
 
 
372 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817145  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1532  hypothetical protein  30.19 
 
 
370 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3650  hypothetical protein  32.6 
 
 
428 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5986  hypothetical protein  32.47 
 
 
452 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0465431  normal  0.123001 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5494  hypothetical protein  29.87 
 
 
369 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542935  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0372  hypothetical protein  33.69 
 
 
412 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2699  hypothetical protein  27.54 
 
 
361 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4414  hypothetical protein  27.67 
 
 
653 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2669  hypothetical protein  27.84 
 
 
360 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2714  hypothetical protein  27.84 
 
 
360 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361474  normal  0.0368583 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3737  hypothetical protein  25.83 
 
 
357 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0338  hypothetical protein  28.96 
 
 
395 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106434  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1940  hypothetical protein  27.55 
 
 
660 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2496  hypothetical protein  25.15 
 
 
403 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0353  hypothetical protein  28.31 
 
 
390 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760546  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4400  hypothetical protein  25.94 
 
 
414 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926858  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4073  hypothetical protein  24.53 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.232287  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2269  hypothetical protein  24.77 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1875  hypothetical protein  24.64 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1941  hypothetical protein  24.35 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1895  hypothetical protein  24.35 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3641  hypothetical protein  27.62 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2231  hypothetical protein  24.52 
 
 
384 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4114  hypothetical protein  24.87 
 
 
382 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488486  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3302  hypothetical protein  28.64 
 
 
405 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4383  hypothetical protein  24.83 
 
 
370 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>