41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0372 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0372  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  837    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5986  hypothetical protein  29.4 
 
 		 452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0465431  normal  0.123001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4414  hypothetical protein  29.63 
 
 		 653 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1940  hypothetical protein  28.64 
 
 		 660 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3650  hypothetical protein  29.95 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0923  hypothetical protein  31.76 
 
 		 403 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3599  hypothetical protein  32.13 
 
 		 385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2756  hypothetical protein  32.24 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00358504  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2834  hypothetical protein  32.34 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2637  hypothetical protein  31.17 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.836054  normal  0.333709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4647  hypothetical protein  31.33 
 
 		 375 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4735  hypothetical protein  31.33 
 
 		 375 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5030  hypothetical protein  31.33 
 
 		 375 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1529  hypothetical protein  32.05 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5229  hypothetical protein  31.36 
 
 		 387 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.127707 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13564  hypothetical protein  31.82 
 
 		 375 aa  108  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000573619 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1532  hypothetical protein  30.57 
 
 		 370 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429844  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4371  hypothetical protein  30 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0338  hypothetical protein  29.18 
 
 		 395 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3292  hypothetical protein  29.35 
 
 		 362 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4829  hypothetical protein  31.07 
 
 		 397 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0353  hypothetical protein  29.6 
 
 		 390 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5494  hypothetical protein  29.31 
 
 		 369 aa  90.9  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3737  hypothetical protein  26.76 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3641  hypothetical protein  27.11 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817145  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2496  hypothetical protein  28.16 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3773  hypothetical protein  24.13 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0308  hypothetical protein  27 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4400  hypothetical protein  26.76 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2699  hypothetical protein  27.13 
 
 		 361 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1875  hypothetical protein  27.54 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2669  hypothetical protein  27.44 
 
 		 360 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2714  hypothetical protein  27.44 
 
 		 360 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361474  normal  0.0368583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1895  hypothetical protein  27.17 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1941  hypothetical protein  27.17 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3302  hypothetical protein  26.96 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4114  hypothetical protein  25.8 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488486  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2269  hypothetical protein  25.42 
 
 		 355 aa  57  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2231  hypothetical protein  25.94 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4073  hypothetical protein  24.91 
 
 		 341 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.232287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3641  hypothetical protein  24.51 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>