38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2671 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2671  hypothetical protein  100 
 
 
676 aa  1356    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0971052  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2701  hypothetical protein  98.24 
 
 
680 aa  1199    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2716  hypothetical protein  100 
 
 
676 aa  1356    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138659  normal  0.0803009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0399  hypothetical protein  37.18 
 
 
701 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.708944  normal  0.4218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0411  hypothetical protein  37.18 
 
 
701 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0420  hypothetical protein  37.18 
 
 
701 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5180  hypothetical protein  37.63 
 
 
692 aa  276  9e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1576  hypothetical protein  37.25 
 
 
676 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.592889  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11772  hypothetical protein  39.49 
 
 
503 aa  242  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00013722  hitchhiker  0.00000000159195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3407  hypothetical protein  37.83 
 
 
438 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3459  hypothetical protein  36.72 
 
 
300 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.972457  normal  0.141777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3396  hypothetical protein  36.72 
 
 
300 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4575  hypothetical protein  34.65 
 
 
429 aa  186  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1631  carbohydrate-binding protein  35.03 
 
 
606 aa  176  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  0.43488 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4414  carbohydrate-binding protein  35.01 
 
 
357 aa  167  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119276  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32500  hypothetical protein  30.53 
 
 
328 aa  161  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2002  hypothetical protein  31.23 
 
 
502 aa  148  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1707  carbohydrate-binding protein  31.32 
 
 
386 aa  136  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  34.16 
 
 
2816 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2501  hypothetical protein  28 
 
 
371 aa  62.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  30.3 
 
 
2305 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  32.86 
 
 
885 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4077  peptidase S15  35.03 
 
 
854 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122952  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1041  peptidase S15  32.6 
 
 
778 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  30.92 
 
 
3378 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1067  peptidase S15  36.07 
 
 
775 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.33 
 
 
1949 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  27.57 
 
 
2310 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2125  hypothetical protein  35.25 
 
 
320 aa  55.1  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5243  hypothetical protein  43.53 
 
 
693 aa  52  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.751292  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4994  hypothetical protein  30.2 
 
 
557 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449903  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1504  hypothetical protein  45.33 
 
 
675 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.37 
 
 
2114 aa  47.4  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5004  hypothetical protein  32.23 
 
 
1039 aa  47.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1994  hypothetical protein  33.57 
 
 
746 aa  46.6  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1718  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.5 
 
 
777 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.1 
 
 
1056 aa  45.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5192  peptidase S15  28.9 
 
 
813 aa  44.7  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606479  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>