23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2125 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2125  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  651    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2970  hypothetical protein  41.43 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.751767  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0806  hypothetical protein  37.46 
 
 		 410 aa  169  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5522  hypothetical protein  34.04 
 
 		 371 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13739  hypothetical protein  28.74 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.101062  normal  0.216027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4887  hypothetical protein  29.57 
 
 		 376 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0537517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4976  hypothetical protein  29.57 
 
 		 376 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5255  hypothetical protein  29.57 
 
 		 376 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5502  hypothetical protein  27.93 
 
 		 350 aa  87  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1306  hypothetical protein  26.51 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2002  hypothetical protein  29.32 
 
 		 502 aa  63.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2501  hypothetical protein  27.76 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2701  hypothetical protein  35.29 
 
 		 680 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32500  hypothetical protein  27.49 
 
 		 328 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2716  hypothetical protein  35.29 
 
 		 676 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138659  normal  0.0803009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2671  hypothetical protein  35.29 
 
 		 676 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0971052  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0411  hypothetical protein  29.12 
 
 		 701 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0399  hypothetical protein  29.12 
 
 		 701 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.708944  normal  0.4218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0420  hypothetical protein  29.12 
 
 		 701 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4414  carbohydrate-binding protein  31.72 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119276  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3407  hypothetical protein  23.19 
 
 		 438 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11772  hypothetical protein  24.56 
 
 		 503 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00013722  hitchhiker  0.00000000159195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1707  carbohydrate-binding protein  35.56 
 
 		 386 aa  43.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>