19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5522 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5522  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  757    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2970  hypothetical protein  51.22 
 
 		 370 aa  347  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.751767  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0806  hypothetical protein  40.41 
 
 		 410 aa  183  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2125  hypothetical protein  34.04 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2501  hypothetical protein  32.02 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1306  hypothetical protein  28.74 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5255  hypothetical protein  28.07 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4976  hypothetical protein  28.79 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4887  hypothetical protein  28.79 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0537517  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5502  hypothetical protein  29.94 
 
 		 350 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13739  hypothetical protein  27.83 
 
 		 336 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.101062  normal  0.216027 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2002  hypothetical protein  27.25 
 
 		 502 aa  83.6  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1631  carbohydrate-binding protein  26.63 
 
 		 606 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  0.43488 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32500  hypothetical protein  24.77 
 
 		 328 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1707  carbohydrate-binding protein  26 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3407  hypothetical protein  24.48 
 
 		 438 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3396  hypothetical protein  23.72 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3459  hypothetical protein  23.72 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.972457  normal  0.141777 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4575  hypothetical protein  23 
 
 		 429 aa  42.7  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>