23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2970 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2970  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  751    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.751767  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5522  hypothetical protein  51.22 
 
 
371 aa  343  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0806  hypothetical protein  44.91 
 
 
410 aa  232  9e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2125  hypothetical protein  41.43 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4887  hypothetical protein  32.36 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0537517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4976  hypothetical protein  32.36 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5255  hypothetical protein  32.36 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13739  hypothetical protein  30.47 
 
 
336 aa  113  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.101062  normal  0.216027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5502  hypothetical protein  30.06 
 
 
350 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2501  hypothetical protein  32.36 
 
 
371 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1306  hypothetical protein  29.11 
 
 
370 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2002  hypothetical protein  27.78 
 
 
502 aa  77  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1631  carbohydrate-binding protein  29.91 
 
 
606 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  0.43488 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11772  hypothetical protein  27.3 
 
 
503 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00013722  hitchhiker  0.00000000159195 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32500  hypothetical protein  27.19 
 
 
328 aa  62.8  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3407  hypothetical protein  28.09 
 
 
438 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3459  hypothetical protein  29.29 
 
 
300 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.972457  normal  0.141777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3396  hypothetical protein  29.29 
 
 
300 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1707  carbohydrate-binding protein  30.22 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4414  carbohydrate-binding protein  26.23 
 
 
357 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119276  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0411  hypothetical protein  26.21 
 
 
701 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0399  hypothetical protein  26.21 
 
 
701 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.708944  normal  0.4218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0420  hypothetical protein  26.21 
 
 
701 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>