24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32500 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_32500  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  647    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2002  hypothetical protein  45.26 
 
 		 502 aa  263  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1631  carbohydrate-binding protein  42.6 
 
 		 606 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  0.43488 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4575  hypothetical protein  36.09 
 
 		 429 aa  205  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4414  carbohydrate-binding protein  39.32 
 
 		 357 aa  203  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119276  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11772  hypothetical protein  38.95 
 
 		 503 aa  203  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00013722  hitchhiker  0.00000000159195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3407  hypothetical protein  35.96 
 
 		 438 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3459  hypothetical protein  35.39 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.972457  normal  0.141777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3396  hypothetical protein  35.39 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0399  hypothetical protein  31.07 
 
 		 701 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.708944  normal  0.4218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0411  hypothetical protein  31.07 
 
 		 701 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0420  hypothetical protein  31.07 
 
 		 701 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2701  hypothetical protein  30.53 
 
 		 680 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2716  hypothetical protein  30.53 
 
 		 676 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138659  normal  0.0803009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2671  hypothetical protein  30.53 
 
 		 676 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0971052  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1707  carbohydrate-binding protein  33.24 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5180  hypothetical protein  31.1 
 
 		 692 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1576  hypothetical protein  31.44 
 
 		 676 aa  136  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.592889  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2501  hypothetical protein  31.43 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5522  hypothetical protein  25.39 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2970  hypothetical protein  27.19 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.751767  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2125  hypothetical protein  27.79 
 
 		 320 aa  57  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1433  hypothetical protein  25.18 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0806  hypothetical protein  33.33 
 
 		 410 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>