14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1433 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1433  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  720    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0648  hypothetical protein  23.1 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1707  carbohydrate-binding protein  25.61 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4575  hypothetical protein  33.33 
 
 		 429 aa  56.2  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2997  hypothetical protein  24.86 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.929467  hitchhiker  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32500  hypothetical protein  25.64 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4414  carbohydrate-binding protein  31.51 
 
 		 357 aa  49.7  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119276  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1576  hypothetical protein  30.83 
 
 		 676 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.592889  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3396  hypothetical protein  25.68 
 
 		 300 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3459  hypothetical protein  25.68 
 
 		 300 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.972457  normal  0.141777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2260  hypothetical protein  23.34 
 
 		 368 aa  46.6  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.39109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3407  hypothetical protein  27.59 
 
 		 438 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11772  hypothetical protein  26.55 
 
 		 503 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00013722  hitchhiker  0.00000000159195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1631  carbohydrate-binding protein  28.75 
 
 		 606 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  0.43488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>