13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0806 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0806  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  818    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2970  hypothetical protein  44.91 
 
 
370 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.751767  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5522  hypothetical protein  40.52 
 
 
371 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2125  hypothetical protein  37.46 
 
 
320 aa  169  9e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5255  hypothetical protein  28.77 
 
 
376 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4887  hypothetical protein  28.49 
 
 
376 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0537517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4976  hypothetical protein  28.49 
 
 
376 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5502  hypothetical protein  28.49 
 
 
350 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13739  hypothetical protein  27.81 
 
 
336 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.101062  normal  0.216027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1306  hypothetical protein  26.32 
 
 
370 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2501  hypothetical protein  27.59 
 
 
371 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32500  hypothetical protein  32.64 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1631  carbohydrate-binding protein  25.56 
 
 
606 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  0.43488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>