63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3709 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3709  peptidase S15  100 
 
 		 519 aa  1036    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00862119  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  28.99 
 
 		 897 aa  146  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4797  peptidase S15  34.88 
 
 		 494 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4077  peptidase S15  37.44 
 
 		 854 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  30.56 
 
 		 868 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  36.17 
 
 		 814 aa  110  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  36.27 
 
 		 876 aa  108  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  30.63 
 
 		 866 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5192  peptidase S15  31.54 
 
 		 813 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  34.12 
 
 		 1010 aa  103  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2538  peptidase S15  33.6 
 
 		 887 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5229  peptidase S15  28.52 
 
 		 806 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.649793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0256  ABC transporter related  28.57 
 
 		 948 aa  94.4  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0296  ABC transporter related  30.13 
 
 		 949 aa  94.4  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.11249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1067  peptidase S15  32.13 
 
 		 775 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  33.53 
 
 		 968 aa  90.9  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  27.87 
 
 		 944 aa  89.7  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1041  peptidase S15  31.34 
 
 		 778 aa  87.4  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0778  ABC transporter related protein  36.69 
 
 		 976 aa  70.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1556  CocE/NonD family hydrolase  24.75 
 
 		 572 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0130  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  24.75 
 
 		 572 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1638  CocE/NonD family hydrolase  24.57 
 
 		 567 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  32.54 
 
 		 286 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  32.54 
 
 		 286 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1243  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.83 
 
 		 572 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0746  hypothetical protein  24.25 
 
 		 532 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1557  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.83 
 
 		 557 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  30.89 
 
 		 301 aa  54.7  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  21.07 
 
 		 497 aa  53.9  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  30.7 
 
 		 237 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3626  hydrolase CocE/NonD family protein  36.7 
 
 		 561 aa  52  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2108  peptidase S15  32.87 
 
 		 782 aa  50.8  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681302  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  31.19 
 
 		 298 aa  50.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  37.97 
 
 		 305 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  34.43 
 
 		 317 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0776  peptidase S15  32.61 
 
 		 517 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  37.97 
 
 		 305 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  22.94 
 
 		 309 aa  48.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  32 
 
 		 524 aa  47.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  27.86 
 
 		 467 aa  47.4  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  24.89 
 
 		 281 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 		 295 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  25.42 
 
 		 316 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 		 295 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2224  hypothetical protein  33.33 
 
 		 267 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  31.3 
 
 		 305 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  26.02 
 
 		 306 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.05 
 
 		 653 aa  46.2  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  26.02 
 
 		 306 aa  45.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04393  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  29.13 
 
 		 218 aa  45.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.890391  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3968  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  28.28 
 
 		 735 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.507879  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  26.02 
 
 		 306 aa  45.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 		 297 aa  44.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  30.58 
 
 		 295 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0146  putative signal peptide protein  25.48 
 
 		 298 aa  44.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.5 
 
 		 315 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  29.82 
 
 		 304 aa  44.3  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  26.02 
 
 		 304 aa  44.3  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4096  peptidase S15  34.43 
 
 		 555 aa  43.9  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  35.44 
 
 		 305 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  26.54 
 
 		 315 aa  43.5  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  39.77 
 
 		 302 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  22.42 
 
 		 271 aa  43.5  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>