44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5229 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5192  peptidase S15  60.31 
 
 
813 aa  802    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606479  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5229  peptidase S15  100 
 
 
806 aa  1602    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.649793  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1067  peptidase S15  54.03 
 
 
775 aa  803    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1041  peptidase S15  60.03 
 
 
778 aa  884    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2538  peptidase S15  46 
 
 
887 aa  429  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4077  peptidase S15  33.45 
 
 
854 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122952  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4797  peptidase S15  38.98 
 
 
494 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  31.36 
 
 
897 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  34.26 
 
 
876 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  31.55 
 
 
866 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  28.93 
 
 
868 aa  132  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  28.85 
 
 
814 aa  112  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  41.22 
 
 
968 aa  92  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  47.92 
 
 
1010 aa  91.3  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47 
 
 
944 aa  86.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0778  ABC transporter related protein  39.42 
 
 
976 aa  85.1  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0296  ABC transporter related  51.58 
 
 
949 aa  80.1  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.11249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3709  peptidase S15  27.99 
 
 
519 aa  79.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00862119  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0256  ABC transporter related  48.98 
 
 
948 aa  78.2  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0574193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1557  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.98 
 
 
557 aa  66.6  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198824  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  33.71 
 
 
299 aa  61.6  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  25.49 
 
 
524 aa  61.2  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1243  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.91 
 
 
572 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1556  CocE/NonD family hydrolase  24.07 
 
 
572 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1638  CocE/NonD family hydrolase  24.07 
 
 
567 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3626  hydrolase CocE/NonD family protein  36.7 
 
 
561 aa  59.7  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0130  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  23.78 
 
 
572 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0776  peptidase S15  24.59 
 
 
517 aa  55.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  24.32 
 
 
595 aa  54.3  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
305 aa  51.6  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0746  hypothetical protein  33.33 
 
 
532 aa  51.2  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1994  hypothetical protein  40 
 
 
746 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04393  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  33.06 
 
 
218 aa  50.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.890391  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  43.75 
 
 
934 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  22.62 
 
 
497 aa  48.9  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4994  hypothetical protein  32.4 
 
 
557 aa  47.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449903  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  32.61 
 
 
320 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  30.14 
 
 
298 aa  46.6  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5180  hypothetical protein  47.27 
 
 
692 aa  46.2  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  35.87 
 
 
368 aa  45.4  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  31.65 
 
 
304 aa  45.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0786  peptidase S15  22.32 
 
 
562 aa  44.3  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.781394  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  29.37 
 
 
315 aa  44.3  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  37.69 
 
 
3378 aa  44.3  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>