33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5179 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5179  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  781    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  35.29 
 
 
898 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  30.65 
 
 
411 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2068  hypothetical protein  30.58 
 
 
432 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183001  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  34.56 
 
 
410 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  30.99 
 
 
401 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  28.24 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  25.93 
 
 
768 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2535  hypothetical protein  28.15 
 
 
409 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4077  peptidase S15  30.84 
 
 
854 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122952  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  28.45 
 
 
783 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  26.54 
 
 
423 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  28.45 
 
 
528 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  25.14 
 
 
421 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  29.25 
 
 
401 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  34.35 
 
 
2305 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0424  hypothetical protein  28.17 
 
 
284 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11208  hypothetical protein  24.32 
 
 
359 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0415  hypothetical protein  28.17 
 
 
284 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0863013  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0403  hypothetical protein  28.17 
 
 
284 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121348  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
469 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  30.43 
 
 
655 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  28.57 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4723  hypothetical protein  27.75 
 
 
416 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795811  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 
1056 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0401  hypothetical protein  28.7 
 
 
380 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.530994  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  25.81 
 
 
388 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  34.96 
 
 
2310 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  25.64 
 
 
431 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0238  hypothetical protein  25.81 
 
 
377 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  25.81 
 
 
377 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  25.81 
 
 
377 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1994  hypothetical protein  32.77 
 
 
746 aa  43.1  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>