46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11208 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11208  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  719    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  47.75 
 
 
388 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  49.17 
 
 
377 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  49.17 
 
 
377 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0238  hypothetical protein  49.17 
 
 
377 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0401  hypothetical protein  49.34 
 
 
380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.530994  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  40.44 
 
 
404 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  43.19 
 
 
307 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  43.19 
 
 
307 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  43.19 
 
 
307 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  39.07 
 
 
401 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  32.61 
 
 
423 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  32.68 
 
 
435 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  33.93 
 
 
479 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3864  hypothetical protein  30.83 
 
 
448 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0367973  normal  0.130474 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  33.76 
 
 
431 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  33.05 
 
 
413 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4723  hypothetical protein  35.78 
 
 
416 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795811  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2535  hypothetical protein  32.67 
 
 
409 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  30.63 
 
 
540 aa  78.2  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  31.25 
 
 
528 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  31.22 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  30.2 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  28.36 
 
 
588 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
469 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  28.57 
 
 
494 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  29.72 
 
 
499 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  34.55 
 
 
458 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  31.55 
 
 
411 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  29.89 
 
 
783 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  27.31 
 
 
655 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  36.61 
 
 
768 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  27.56 
 
 
580 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  24.6 
 
 
421 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5179  hypothetical protein  24.32 
 
 
396 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  26.96 
 
 
468 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  32.14 
 
 
341 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  32.14 
 
 
341 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  25.87 
 
 
413 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  25.87 
 
 
433 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  25.87 
 
 
433 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  25.34 
 
 
502 aa  43.5  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  24.43 
 
 
533 aa  43.9  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  33.94 
 
 
517 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  35 
 
 
533 aa  42.7  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  30 
 
 
427 aa  42.7  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>