44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0238 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  92.29 
 
 
388 aa  694    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0238  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  750    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  99.73 
 
 
377 aa  749    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  99.73 
 
 
377 aa  749    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0401  hypothetical protein  82.89 
 
 
380 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.530994  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11208  hypothetical protein  47.61 
 
 
359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  42.99 
 
 
404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  37.5 
 
 
307 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  37.5 
 
 
307 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  37.5 
 
 
307 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  39.49 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  36.67 
 
 
479 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  33.2 
 
 
435 aa  106  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  32.63 
 
 
423 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  34.68 
 
 
431 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4723  hypothetical protein  35.39 
 
 
416 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795811  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  31.05 
 
 
413 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2535  hypothetical protein  32.9 
 
 
409 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3864  hypothetical protein  28.21 
 
 
448 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0367973  normal  0.130474 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  29.81 
 
 
528 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  27.94 
 
 
580 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  28.05 
 
 
655 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  26.11 
 
 
401 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  26.64 
 
 
588 aa  62  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  28.38 
 
 
468 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  27.68 
 
 
494 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  30.56 
 
 
411 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
469 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  26.78 
 
 
391 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  25.25 
 
 
783 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  27.13 
 
 
540 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  29.08 
 
 
768 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  25.43 
 
 
458 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  24.69 
 
 
533 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  30.43 
 
 
517 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  28.3 
 
 
502 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  30.43 
 
 
517 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  30.43 
 
 
517 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  30.09 
 
 
499 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  30.09 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  30.09 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  26.37 
 
 
421 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  25.12 
 
 
517 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5179  hypothetical protein  25.81 
 
 
396 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>