130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10160 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  100 
 
 		 468 aa  927    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  53.69 
 
 		 502 aa  464  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  46.53 
 
 		 588 aa  298  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  47.61 
 
 		 528 aa  290  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  46.69 
 
 		 533 aa  231  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  43.43 
 
 		 655 aa  219  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  43.85 
 
 		 580 aa  209  7e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  35.76 
 
 		 526 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  33.77 
 
 		 517 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  32.53 
 
 		 540 aa  123  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  33.44 
 
 		 517 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  33.44 
 
 		 517 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  34.1 
 
 		 499 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  35.62 
 
 		 533 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  34.19 
 
 		 517 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  31.99 
 
 		 427 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  37.7 
 
 		 341 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  37.7 
 
 		 341 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  34.64 
 
 		 307 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  34.64 
 
 		 307 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  34.64 
 
 		 307 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11480  PE-PGRS family protein  54.17 
 
 		 737 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.94455e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  32.16 
 
 		 433 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  32.16 
 
 		 433 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  29.43 
 
 		 529 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  29.43 
 
 		 529 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  32.16 
 
 		 413 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5244  hypothetical protein  34.32 
 
 		 433 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10995  PE-PGRS family protein  52.13 
 
 		 923 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.02084e-24  normal  0.770391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11478  PE-PGRS family protein  57.29 
 
 		 1407 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000217058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10889  PE-PGRS family protein  56.38 
 
 		 609 aa  87  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.275087  normal  0.540095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13114  hypothetical protein  47.96 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.773081 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12868  PE-PGRS family protein  51.06 
 
 		 663 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00218222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  29.41 
 
 		 527 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11086  PE-PGRS family protein  53.68 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.21582e-33  normal  0.255 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1238  hypothetical protein  28.85 
 
 		 518 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12014  PE-PGRS family protein  53.76 
 
 		 558 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  30.71 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10849  PE-PGRS family protein  56.41 
 
 		 879 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.4370299999999996e-27  hitchhiker  0.00000147431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12611  PE-PGRS family protein  59.52 
 
 		 543 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0987331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12513  PE-PGRS family protein  55.79 
 
 		 272 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.7912e-70  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11269  PE-PGRS family protein  58.97 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119088  hitchhiker  0.00152162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11796  PE-PGRS family protein  56.38 
 
 		 618 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000152846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  33.49 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13628  PE-PGRS family protein  53.09 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000236295  normal  0.0644121 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13623  PE-PGRS family protein  59.57 
 
 		 584 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.91824e-18  normal  0.0516609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11357  PE-PGRS family protein  55.13 
 
 		 603 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0271727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12540  PE family protein  48.8 
 
 		 492 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000611241  hitchhiker  0.0026092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  28.63 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11105  PE-PGRS family protein  51.28 
 
 		 779 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.19894e-57  normal  0.745031 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12351  PE family protein  45.74 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11085  PE-PGRS family protein  56.25 
 
 		 667 aa  70.1  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.21525e-28  normal  0.25323 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13378  PE-PGRS family protein  57.65 
 
 		 1570 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.793451  normal  0.887646 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13846  PE-PGRS family protein  52 
 
 		 504 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200621  normal  0.262827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11469  PE-PGRS family protein  52.87 
 
 		 491 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0503304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  28.95 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  27.49 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13422  PE-PGRS family protein  52.04 
 
 		 731 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000255336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  28.34 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  30.43 
 
 		 542 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  30.43 
 
 		 542 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  30.43 
 
 		 542 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12424  PE-PGRS family protein  50.57 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.712465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  27.59 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11848  PE-PGRS family protein  58.75 
 
 		 518 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.114393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13545  PE-PGRS family protein  46.81 
 
 		 1888 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000435663  hitchhiker  0.000141751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10588  PE-PGRS family protein  53.75 
 
 		 1306 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00297042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11663  PE family protein  45 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12192  PE-PGRS family protein  58.51 
 
 		 532 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9578499999999997e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11197  PE family protein  57.14 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12754  PE-PGRS family protein  54.88 
 
 		 565 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000417196  normal  0.0386161 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11834  PE-PGRS family protein  45.68 
 
 		 650 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00239965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  30.62 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  27.4 
 
 		 783 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13512  PE family protein  42.55 
 
 		 98 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.951509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13547  PE-PGRS family protein  50.62 
 
 		 1086 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.98986e-36  hitchhiker  0.0000786536 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  29.06 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  32.89 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  29.05 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  29.05 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13542  PE-PGRS family protein  50.62 
 
 		 2332 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000034434  hitchhiker  0.00332748 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0238  hypothetical protein  29.05 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0401  hypothetical protein  28.63 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.530994  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12653  PE-PGRS family protein  53.12 
 
 		 788 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000028408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11818  PE family protein  49.43 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.850225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10110  PE-PGRS family protein  50 
 
 		 533 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11112  PE-PGRS family protein  56.41 
 
 		 853 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336586  normal  0.286221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11821  PE family protein  49.43 
 
 		 105 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.784266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  26.72 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  49.46 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10125  PE-PGRS family protein  58.75 
 
 		 561 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000011228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10996  PE-PGRS family protein  48.94 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7191000000000003e-35  normal  0.547752 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10304  PE-PGRS family protein  54.26 
 
 		 622 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0360601  normal  0.165119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12364  PE-PGRS family protein  50 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11425  PE-PGRS family protein  55 
 
 		 576 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000100458  normal  0.0951709 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11783  PE-PGRS family protein  55 
 
 		 911 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.68379e-22  hitchhiker  0.0000000263323 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12634  PE-PGRS family protein  43.7 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000268791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10934  PE family protein  40.79 
 
 		 99 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11107  PE family protein  47.13 
 
 		 144 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.16688e-86  normal  0.558306 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>