63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1782 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  100 
 
 
307 aa  610  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  610  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  610  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  42.34 
 
 
401 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11208  hypothetical protein  43.19 
 
 
359 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  37.5 
 
 
377 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  37.5 
 
 
377 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0238  hypothetical protein  37.5 
 
 
377 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0401  hypothetical protein  40.1 
 
 
380 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.530994  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  36.16 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  35.29 
 
 
528 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  38.33 
 
 
435 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  36.3 
 
 
413 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  36.3 
 
 
433 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  36.3 
 
 
433 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  35.32 
 
 
423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4723  hypothetical protein  37.74 
 
 
416 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795811  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  35.61 
 
 
404 aa  102  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  40.49 
 
 
494 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  32.52 
 
 
580 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  35.68 
 
 
458 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  38.82 
 
 
655 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  34.74 
 
 
431 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  33.51 
 
 
401 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  31.71 
 
 
413 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  31.03 
 
 
391 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3864  hypothetical protein  32.37 
 
 
448 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0367973  normal  0.130474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  36.18 
 
 
768 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2535  hypothetical protein  37.39 
 
 
409 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  34.64 
 
 
468 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  28.16 
 
 
526 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  31.52 
 
 
588 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  36.14 
 
 
542 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  36.14 
 
 
542 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  36.14 
 
 
542 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  36.41 
 
 
479 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  29.59 
 
 
502 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  34.04 
 
 
499 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  33.18 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  28.78 
 
 
533 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  31.3 
 
 
783 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 
469 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  29.2 
 
 
540 aa  79.3  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  30.52 
 
 
517 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  30.98 
 
 
517 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  30.98 
 
 
517 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  30.58 
 
 
421 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  31.38 
 
 
517 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  42.31 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2068  hypothetical protein  40.91 
 
 
432 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183001  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  43.69 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  43.69 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  32.38 
 
 
533 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  30.07 
 
 
427 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  28.99 
 
 
898 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0424  hypothetical protein  27.92 
 
 
284 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0403  hypothetical protein  27.92 
 
 
284 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121348  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0415  hypothetical protein  27.92 
 
 
284 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0863013  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0021  hypothetical protein  25 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.317886  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2044  hypothetical protein  35.66 
 
 
324 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1403  hypothetical protein  33.85 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.663711  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  27.24 
 
 
527 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5244  hypothetical protein  27.78 
 
 
433 aa  42.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>