66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0407 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  99.12 
 
 
341 aa  659    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  100 
 
 
499 aa  984    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  99.12 
 
 
341 aa  659    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0420  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0429  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0166778  normal  0.346421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  33.64 
 
 
526 aa  200  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  33.82 
 
 
517 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  33.82 
 
 
517 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  34.75 
 
 
517 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  40.13 
 
 
427 aa  167  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  38.6 
 
 
517 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  33.66 
 
 
533 aa  146  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5244  hypothetical protein  39.07 
 
 
433 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  34.58 
 
 
540 aa  143  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  39.68 
 
 
580 aa  131  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  34.75 
 
 
468 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  36.78 
 
 
502 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  39.33 
 
 
528 aa  119  9e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  38.95 
 
 
533 aa  113  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  33.96 
 
 
655 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  38.12 
 
 
588 aa  107  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  34.93 
 
 
411 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  30.67 
 
 
542 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  30.67 
 
 
542 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  30.67 
 
 
542 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  34 
 
 
421 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  36.9 
 
 
307 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  36.9 
 
 
307 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  36.9 
 
 
307 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  30.79 
 
 
529 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  30.79 
 
 
529 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  35.33 
 
 
391 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  31.86 
 
 
768 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  29.47 
 
 
527 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  35.71 
 
 
410 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  32.09 
 
 
433 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  32.09 
 
 
413 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  32.09 
 
 
433 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
469 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  29.49 
 
 
494 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  29.87 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  35.64 
 
 
458 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  31.99 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2068  hypothetical protein  32.82 
 
 
432 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183001  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  33.33 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  32.28 
 
 
783 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  32.87 
 
 
898 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1238  hypothetical protein  28.57 
 
 
518 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  29.82 
 
 
413 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  29.13 
 
 
423 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  31.25 
 
 
431 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3864  hypothetical protein  27.11 
 
 
448 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0367973  normal  0.130474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  27.81 
 
 
435 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0401  hypothetical protein  30.61 
 
 
380 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.530994  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  30.43 
 
 
388 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  28.06 
 
 
377 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0238  hypothetical protein  28.06 
 
 
377 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  28.06 
 
 
377 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0415  hypothetical protein  26.98 
 
 
284 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0863013  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0403  hypothetical protein  26.98 
 
 
284 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121348  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0424  hypothetical protein  26.98 
 
 
284 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11208  hypothetical protein  28.92 
 
 
359 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4081  hypothetical protein  24.17 
 
 
461 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0716576  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5179  hypothetical protein  30.46 
 
 
396 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2535  hypothetical protein  27.76 
 
 
409 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0021  hypothetical protein  27.72 
 
 
390 aa  43.9  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.317886  normal  0.79762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>