56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4815 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  100 
 
 
517 aa  1009    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  60.14 
 
 
533 aa  435  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  46.34 
 
 
517 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  46.34 
 
 
517 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  45.85 
 
 
517 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  38.89 
 
 
526 aa  200  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  38.6 
 
 
499 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  40.93 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  40.93 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  41.84 
 
 
427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  35.12 
 
 
580 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  34.32 
 
 
588 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  31.83 
 
 
502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  34.19 
 
 
468 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  32.41 
 
 
533 aa  107  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  32.5 
 
 
528 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  31.51 
 
 
540 aa  104  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  31.77 
 
 
655 aa  103  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5244  hypothetical protein  39.3 
 
 
433 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  32.11 
 
 
411 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  32.42 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  31.38 
 
 
307 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  31.38 
 
 
307 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  31.38 
 
 
307 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  29.67 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  34.66 
 
 
494 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  29.83 
 
 
768 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  30.69 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  30.43 
 
 
542 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  30.43 
 
 
542 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  30.43 
 
 
542 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  34.55 
 
 
458 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  29.41 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  24.53 
 
 
527 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  24.06 
 
 
529 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  24.06 
 
 
529 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2068  hypothetical protein  29.24 
 
 
432 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183001  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  30.39 
 
 
433 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  30.39 
 
 
433 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  30.39 
 
 
413 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
469 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  30.92 
 
 
401 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  28.57 
 
 
783 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4081  hypothetical protein  26.53 
 
 
461 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0716576  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  25.88 
 
 
423 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3864  hypothetical protein  33.59 
 
 
448 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0367973  normal  0.130474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  34.23 
 
 
435 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1238  hypothetical protein  22.39 
 
 
518 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0021  hypothetical protein  29.91 
 
 
390 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.317886  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6888  response regulator receiver protein  39.73 
 
 
875 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3668  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  25 
 
 
413 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  25.37 
 
 
388 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  25.24 
 
 
377 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  25.24 
 
 
377 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0238  hypothetical protein  25.24 
 
 
377 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0769  hypothetical protein  50 
 
 
378 aa  43.5  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.994744  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>