44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0970 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  77.82 
 
 
529 aa  727    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  100 
 
 
527 aa  1057    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  77.82 
 
 
529 aa  727    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1238  hypothetical protein  40.67 
 
 
518 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  39.95 
 
 
540 aa  241  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  30.56 
 
 
528 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  28.24 
 
 
580 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  25.13 
 
 
517 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  25.13 
 
 
517 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  31.82 
 
 
542 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  31.82 
 
 
542 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  31.82 
 
 
542 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  25.38 
 
 
517 aa  93.6  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  30.4 
 
 
502 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  29.41 
 
 
468 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  28.42 
 
 
499 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  25.25 
 
 
526 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  27.6 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  27.6 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  27.6 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  25.07 
 
 
517 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  26.61 
 
 
655 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  31.22 
 
 
494 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  28.68 
 
 
458 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  26.21 
 
 
427 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  26.52 
 
 
533 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  28.95 
 
 
588 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  27.69 
 
 
431 aa  57  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0017  hypothetical protein  28.04 
 
 
630 aa  56.6  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  25.61 
 
 
404 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  25.94 
 
 
768 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  29.09 
 
 
423 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  29.81 
 
 
341 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  29.81 
 
 
341 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  29.03 
 
 
421 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  24.4 
 
 
533 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  25.45 
 
 
413 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1762  hypothetical protein  22.14 
 
 
623 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635017  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  25.32 
 
 
410 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  26.71 
 
 
435 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  26.75 
 
 
783 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  27.92 
 
 
391 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4691  hypothetical protein  35.37 
 
 
451 aa  43.5  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  30 
 
 
401 aa  43.5  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>