64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4030 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  100 
 
 		 540 aa  1049    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  34.9 
 
 		 529 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  34.9 
 
 		 529 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  35.84 
 
 		 527 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1238  hypothetical protein  31.66 
 
 		 518 aa  167  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  28.1 
 
 		 526 aa  144  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  34.64 
 
 		 580 aa  143  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  30.5 
 
 		 499 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  33.64 
 
 		 528 aa  137  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  29.35 
 
 		 517 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  29.35 
 
 		 517 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  29.57 
 
 		 517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0017  hypothetical protein  48.07 
 
 		 630 aa  130  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  32.53 
 
 		 468 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  29.43 
 
 		 502 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  31.99 
 
 		 533 aa  114  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  31.23 
 
 		 655 aa  109  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  30.38 
 
 		 517 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  32.24 
 
 		 533 aa  104  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  35.51 
 
 		 341 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  35.51 
 
 		 341 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  30.79 
 
 		 433 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  30.79 
 
 		 433 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  30.79 
 
 		 413 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5244  hypothetical protein  36.12 
 
 		 433 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  28.41 
 
 		 542 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  28.41 
 
 		 542 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  28.41 
 
 		 542 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  32.32 
 
 		 427 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  27.85 
 
 		 588 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  31.3 
 
 		 401 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  29.66 
 
 		 458 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  32.23 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  28.12 
 
 		 494 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  29.2 
 
 		 307 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  29.2 
 
 		 307 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  29.2 
 
 		 307 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  33.49 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  29.26 
 
 		 768 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  31.05 
 
 		 783 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  29.59 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 469 aa  70.5  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  27.11 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  32.06 
 
 		 404 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11208  hypothetical protein  30.63 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  29.17 
 
 		 410 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  32.92 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2068  hypothetical protein  31.46 
 
 		 432 aa  62  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183001  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  30.06 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  32.69 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  27.68 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  28.1 
 
 		 401 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0401  hypothetical protein  26.51 
 
 		 380 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.530994  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  27.56 
 
 		 377 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  27.56 
 
 		 377 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0238  hypothetical protein  27.56 
 
 		 377 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4692  hypothetical protein  28.41 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4312  hypothetical protein  28.41 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.400597  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4398  hypothetical protein  28.41 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2535  hypothetical protein  27.75 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  32.52 
 
 		 898 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3864  hypothetical protein  22.79 
 
 		 448 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0367973  normal  0.130474 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  34.09 
 
 		 479 aa  43.9  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1762  hypothetical protein  25.61 
 
 		 623 aa  43.5  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>