61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4281 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  97.68 
 
 
517 aa  1007    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  100 
 
 
517 aa  1029    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  100 
 
 
517 aa  1029    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  46.34 
 
 
517 aa  300  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  48.36 
 
 
533 aa  282  9e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  36.83 
 
 
526 aa  198  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  33.82 
 
 
499 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  29.57 
 
 
540 aa  133  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  37.63 
 
 
341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  33.43 
 
 
502 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  37.63 
 
 
341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  34.5 
 
 
580 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  34.11 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  36.43 
 
 
588 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  37.07 
 
 
528 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  37.37 
 
 
427 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5244  hypothetical protein  35.17 
 
 
433 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  30.77 
 
 
655 aa  102  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  34.94 
 
 
533 aa  100  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  35.06 
 
 
458 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  28.49 
 
 
542 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  28.49 
 
 
542 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  25.13 
 
 
527 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  28.49 
 
 
542 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  24.85 
 
 
529 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  24.85 
 
 
529 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  32.39 
 
 
494 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  33.5 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  35.14 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  36.22 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  30.98 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  30.98 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  30.98 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  33.15 
 
 
768 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  31.79 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  34.47 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  30 
 
 
433 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  29.27 
 
 
401 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  30 
 
 
433 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  30 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
469 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1238  hypothetical protein  25.23 
 
 
518 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2068  hypothetical protein  33.17 
 
 
432 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183001  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  25.86 
 
 
783 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  26.42 
 
 
423 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  27.67 
 
 
404 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  32.17 
 
 
388 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  30.43 
 
 
377 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4692  hypothetical protein  28.57 
 
 
437 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0238  hypothetical protein  30.43 
 
 
377 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4312  hypothetical protein  28.57 
 
 
437 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.400597  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4081  hypothetical protein  29 
 
 
461 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0716576  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4398  hypothetical protein  28.57 
 
 
437 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  30.43 
 
 
377 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0401  hypothetical protein  32.17 
 
 
380 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.530994  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3864  hypothetical protein  26.29 
 
 
448 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0367973  normal  0.130474 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4691  hypothetical protein  32.56 
 
 
451 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  34.91 
 
 
413 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  31.3 
 
 
435 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4311  PE-PPE-like protein  38.54 
 
 
451 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4397  hypothetical protein  38.54 
 
 
451 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>