63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4951 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  866    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  99.76 
 
 
413 aa  822    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  100 
 
 
433 aa  866    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  36.12 
 
 
655 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  36.3 
 
 
307 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  36.3 
 
 
307 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  36.3 
 
 
307 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  35.77 
 
 
528 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  33.85 
 
 
588 aa  102  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  31.53 
 
 
540 aa  101  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  31.7 
 
 
502 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  34.24 
 
 
533 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  32 
 
 
580 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  32.16 
 
 
468 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  34.8 
 
 
391 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  33.33 
 
 
427 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  30.04 
 
 
401 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  37.38 
 
 
401 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  31.37 
 
 
529 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  31.37 
 
 
529 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  30.35 
 
 
431 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  31.53 
 
 
499 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  28.06 
 
 
526 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  30.7 
 
 
527 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3864  hypothetical protein  27.63 
 
 
448 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0367973  normal  0.130474 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  32.2 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  25.77 
 
 
542 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  25.77 
 
 
542 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  25.77 
 
 
542 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  29.97 
 
 
533 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  29.11 
 
 
517 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  30 
 
 
517 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  29.11 
 
 
517 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5244  hypothetical protein  28.57 
 
 
433 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  30.39 
 
 
517 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1238  hypothetical protein  28.17 
 
 
518 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  29.02 
 
 
458 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  29.41 
 
 
411 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  30.35 
 
 
494 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  26.56 
 
 
768 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  28.71 
 
 
413 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  31.32 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  31.32 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  29.27 
 
 
435 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  27.08 
 
 
404 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  29.65 
 
 
421 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4312  hypothetical protein  28.91 
 
 
437 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.400597  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4398  hypothetical protein  28.91 
 
 
437 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4692  hypothetical protein  28.91 
 
 
437 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0130  ATPase  31.03 
 
 
763 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0120  ATPase  31.03 
 
 
762 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0139  ATPase  31.03 
 
 
763 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2535  hypothetical protein  26.28 
 
 
409 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2068  hypothetical protein  28.43 
 
 
432 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183001  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  29.08 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4931  hypothetical protein  28.11 
 
 
804 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809963  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4548  hypothetical protein  28.11 
 
 
804 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.601253  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4635  hypothetical protein  29.5 
 
 
774 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.378265  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
469 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  25 
 
 
388 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  25.95 
 
 
783 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  33.33 
 
 
479 aa  44.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0021  hypothetical protein  25.32 
 
 
390 aa  43.1  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.317886  normal  0.79762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>