23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4312 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4312  hypothetical protein  100 
 
 
437 aa  881    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.400597  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4398  hypothetical protein  100 
 
 
437 aa  881    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4692  hypothetical protein  99.54 
 
 
437 aa  877    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4081  hypothetical protein  38.82 
 
 
461 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0716576  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4311  PE-PPE-like protein  36.79 
 
 
451 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4397  hypothetical protein  36.79 
 
 
451 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4691  hypothetical protein  35.31 
 
 
451 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  32.99 
 
 
391 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  28.52 
 
 
433 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  28.52 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  28.52 
 
 
433 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  28.57 
 
 
517 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  28.57 
 
 
517 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  28.49 
 
 
540 aa  50.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  28.4 
 
 
517 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  27.8 
 
 
542 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  24.78 
 
 
401 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  27.8 
 
 
542 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  28.38 
 
 
421 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  29.95 
 
 
533 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  27.8 
 
 
542 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  27.46 
 
 
768 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  29.8 
 
 
580 aa  43.9  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>