49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0276 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  90.96 
 
 
377 aa  652    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  90.96 
 
 
377 aa  652    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0238  hypothetical protein  90.69 
 
 
377 aa  650    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  776    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0401  hypothetical protein  83.68 
 
 
380 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.530994  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11208  hypothetical protein  47.75 
 
 
359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  38.04 
 
 
404 aa  166  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  36.16 
 
 
307 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  36.16 
 
 
307 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  36.16 
 
 
307 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  39.11 
 
 
401 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  33.33 
 
 
435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  36.67 
 
 
479 aa  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  31.46 
 
 
423 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  35.29 
 
 
431 aa  106  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4723  hypothetical protein  35.71 
 
 
416 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795811  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  34.27 
 
 
413 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3864  hypothetical protein  30.04 
 
 
448 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0367973  normal  0.130474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2535  hypothetical protein  33.33 
 
 
409 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  29.93 
 
 
528 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  28.43 
 
 
401 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  28.57 
 
 
580 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  29.37 
 
 
655 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  27.95 
 
 
588 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  31.11 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  27.68 
 
 
494 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  28.67 
 
 
468 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  28.02 
 
 
391 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
469 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  25 
 
 
783 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  27.35 
 
 
458 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  26.85 
 
 
540 aa  56.2  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  27.69 
 
 
768 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  32.17 
 
 
517 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  32.17 
 
 
517 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  32.17 
 
 
517 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  25.31 
 
 
533 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  29.63 
 
 
502 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  30.97 
 
 
499 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  30.97 
 
 
341 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  30.97 
 
 
341 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  25.74 
 
 
421 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  29.79 
 
 
427 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  25 
 
 
433 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  25 
 
 
433 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  25 
 
 
413 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5179  hypothetical protein  25.81 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  25.37 
 
 
517 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  24.49 
 
 
410 aa  43.1  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>