65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3374 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  100 
 
 
421 aa  845    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  54.37 
 
 
411 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  45.26 
 
 
469 aa  197  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2068  hypothetical protein  40.98 
 
 
432 aa  196  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183001  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  38.87 
 
 
410 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  38.24 
 
 
768 aa  172  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  44.08 
 
 
401 aa  169  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  35.53 
 
 
391 aa  159  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  40.82 
 
 
783 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  34.36 
 
 
898 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  34.17 
 
 
499 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  30.77 
 
 
528 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0021  hypothetical protein  29.41 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.317886  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  39.66 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  39.66 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  30.77 
 
 
517 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  30.58 
 
 
307 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  31.79 
 
 
517 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  30.58 
 
 
307 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  31.79 
 
 
517 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  30.58 
 
 
307 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  28.87 
 
 
526 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  28.14 
 
 
655 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  30.38 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  35.94 
 
 
533 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  29.08 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  29.51 
 
 
517 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  29.59 
 
 
540 aa  67.4  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  26.8 
 
 
431 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  27.93 
 
 
580 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0415  hypothetical protein  29.71 
 
 
284 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0863013  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0403  hypothetical protein  29.71 
 
 
284 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121348  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0424  hypothetical protein  29.71 
 
 
284 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  28.57 
 
 
427 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  27.46 
 
 
423 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  30.8 
 
 
458 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  32.74 
 
 
588 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  25.51 
 
 
502 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  29.44 
 
 
533 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  29.8 
 
 
542 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  29.8 
 
 
542 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  29.8 
 
 
542 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  28.65 
 
 
435 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4081  hypothetical protein  25.15 
 
 
461 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0716576  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5244  hypothetical protein  26.32 
 
 
433 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  28.87 
 
 
468 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3864  hypothetical protein  28.3 
 
 
448 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0367973  normal  0.130474 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  27.91 
 
 
413 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  27.91 
 
 
433 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  27.91 
 
 
433 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  29.03 
 
 
527 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5179  hypothetical protein  25.14 
 
 
396 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  33.17 
 
 
404 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  28.22 
 
 
529 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  26.92 
 
 
494 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  28.22 
 
 
529 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  26.11 
 
 
388 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  26.37 
 
 
377 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  26.37 
 
 
377 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0238  hypothetical protein  26.37 
 
 
377 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4312  hypothetical protein  28.38 
 
 
437 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.400597  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4692  hypothetical protein  28.38 
 
 
437 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4398  hypothetical protein  28.38 
 
 
437 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2535  hypothetical protein  29.05 
 
 
409 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0401  hypothetical protein  28.07 
 
 
380 aa  43.5  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.530994  normal  0.562815 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>