140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11831 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  100 
 
 
655 aa  1291    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  42.83 
 
 
588 aa  353  5e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  50.26 
 
 
533 aa  347  3e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  42.02 
 
 
580 aa  333  7.000000000000001e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  44.48 
 
 
502 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  45.61 
 
 
528 aa  243  6e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  43.43 
 
 
468 aa  218  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  67.07 
 
 
760 aa  180  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  62.86 
 
 
409 aa  167  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  60.89 
 
 
3295 aa  164  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  59.09 
 
 
975 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  65.06 
 
 
645 aa  161  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  64.57 
 
 
582 aa  160  7e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  37.86 
 
 
479 aa  156  9e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  56.57 
 
 
487 aa  151  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  63.48 
 
 
448 aa  150  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  57.47 
 
 
1457 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  60.11 
 
 
3166 aa  148  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  56.97 
 
 
409 aa  144  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  61.05 
 
 
1013 aa  143  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  66.01 
 
 
3787 aa  143  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  58.33 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  51.63 
 
 
396 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  50.87 
 
 
423 aa  140  7e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000026976  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  54.9 
 
 
380 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  49.02 
 
 
392 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  51.35 
 
 
391 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  58.33 
 
 
551 aa  131  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000128496  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  51.33 
 
 
443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000154935  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  52.44 
 
 
385 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  58.08 
 
 
391 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  65.38 
 
 
590 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  65.79 
 
 
2532 aa  127  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  56 
 
 
403 aa  127  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  49.4 
 
 
406 aa  127  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000859509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  34.64 
 
 
526 aa  127  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  54.88 
 
 
408 aa  123  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  57.93 
 
 
463 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031557  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  52.29 
 
 
350 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  50.3 
 
 
470 aa  121  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  52.29 
 
 
350 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  55.56 
 
 
423 aa  120  9e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11157  PPE family protein  62.64 
 
 
636 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.38215e-17  normal  0.405765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  56.41 
 
 
394 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  36.12 
 
 
433 aa  115  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  36.12 
 
 
413 aa  115  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  36.12 
 
 
433 aa  115  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  56 
 
 
393 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  52.29 
 
 
382 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  31.1 
 
 
540 aa  108  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  33.44 
 
 
533 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  31.68 
 
 
517 aa  104  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  39.23 
 
 
391 aa  104  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  33.18 
 
 
427 aa  103  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  30.77 
 
 
517 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  30.77 
 
 
517 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  31.75 
 
 
517 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  53.33 
 
 
394 aa  101  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  32.83 
 
 
499 aa  101  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  38.82 
 
 
307 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  38.82 
 
 
307 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  38.82 
 
 
307 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13381  PPE family protein  64.54 
 
 
647 aa  97.1  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00213792  normal  0.0214486 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5244  hypothetical protein  38.54 
 
 
433 aa  94.7  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  34.85 
 
 
411 aa  94  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12382  PPE family protein  56.76 
 
 
615 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105692  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  54.05 
 
 
413 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11057  PPE family protein  53.33 
 
 
391 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.824067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  29.25 
 
 
494 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  33.81 
 
 
401 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  34.48 
 
 
401 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  30.87 
 
 
458 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  31.14 
 
 
194 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13459  PPE family protein  33.13 
 
 
173 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.091e-18  hitchhiker  0.000474891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  38.96 
 
 
346 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  44.44 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  34.16 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  34.16 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13465  PPE family protein  33.33 
 
 
178 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213323  hitchhiker  0.000182876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13462  PPE family protein  31.55 
 
 
180 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119714  decreased coverage  0.000040288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  34.81 
 
 
445 aa  79  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  30.12 
 
 
423 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  37.01 
 
 
436 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12379  PPE family protein  55.25 
 
 
613 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000086115  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13458  hypothetical protein  30.95 
 
 
176 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423938  hitchhiker  0.0000923952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  31 
 
 
556 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
469 aa  73.9  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  28.14 
 
 
421 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  27.3 
 
 
527 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  37.42 
 
 
443 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  37.42 
 
 
443 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  37.42 
 
 
443 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  38.12 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  32.88 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  37.16 
 
 
518 aa  71.2  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  36.3 
 
 
463 aa  70.5  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  26.94 
 
 
431 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1238  hypothetical protein  27.96 
 
 
518 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  32.89 
 
 
539 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793928  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  29.37 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>