48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3864 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3864  hypothetical protein  100 
 
 
448 aa  892    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0367973  normal  0.130474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2535  hypothetical protein  69.23 
 
 
409 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  62.63 
 
 
435 aa  346  6e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  58.6 
 
 
423 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  53.9 
 
 
413 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  53.72 
 
 
431 aa  279  7e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  32.12 
 
 
307 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  32.12 
 
 
307 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  32.12 
 
 
307 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  30.04 
 
 
388 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  36.22 
 
 
401 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  33.05 
 
 
404 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0401  hypothetical protein  30.43 
 
 
380 aa  89  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.530994  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  28.21 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  28.21 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0238  hypothetical protein  28.21 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4723  hypothetical protein  31.44 
 
 
416 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795811  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11208  hypothetical protein  30.83 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  27.7 
 
 
528 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  27.68 
 
 
433 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  27.68 
 
 
433 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  27.39 
 
 
588 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  27.68 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  29.26 
 
 
580 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
469 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  25.79 
 
 
526 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  30.77 
 
 
533 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  30.56 
 
 
411 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  33.33 
 
 
479 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  27.07 
 
 
401 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  27 
 
 
783 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  25.69 
 
 
499 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  30.59 
 
 
768 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  28.98 
 
 
391 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2068  hypothetical protein  28.24 
 
 
432 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183001  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  27.13 
 
 
540 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  26.12 
 
 
468 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  24.53 
 
 
410 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  25.6 
 
 
517 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  33.59 
 
 
517 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  25.91 
 
 
517 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  25.91 
 
 
517 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0021  hypothetical protein  24.24 
 
 
390 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.317886  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  32.08 
 
 
341 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  32.08 
 
 
341 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  29.92 
 
 
427 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  26.94 
 
 
655 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5244  hypothetical protein  26.72 
 
 
433 aa  43.1  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>