125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10161 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  100 
 
 
502 aa  1000    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  53.69 
 
 
468 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  42.54 
 
 
588 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  43.39 
 
 
528 aa  260  4e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  35.56 
 
 
655 aa  241  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  45.04 
 
 
533 aa  226  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  41.12 
 
 
580 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  33.02 
 
 
526 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  32.87 
 
 
517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  32.87 
 
 
517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  33.15 
 
 
517 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  30.42 
 
 
540 aa  120  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  31.83 
 
 
517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  35.25 
 
 
499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12868  PE-PGRS family protein  51.59 
 
 
663 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00218222  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  32.66 
 
 
533 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10889  PE-PGRS family protein  53.97 
 
 
609 aa  109  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.275087  normal  0.540095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10995  PE-PGRS family protein  48.84 
 
 
923 aa  103  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.02084e-24  normal  0.770391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11480  PE-PGRS family protein  48.74 
 
 
737 aa  100  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.94455e-50  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12014  PE-PGRS family protein  53.73 
 
 
558 aa  100  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  29.02 
 
 
529 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  29.02 
 
 
529 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11796  PE-PGRS family protein  56.35 
 
 
618 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000152846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  32.35 
 
 
433 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  32.35 
 
 
433 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11086  PE-PGRS family protein  49.6 
 
 
463 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.21582e-33  normal  0.255 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  32.35 
 
 
413 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12513  PE-PGRS family protein  50.82 
 
 
272 aa  94  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.7912e-70  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11478  PE-PGRS family protein  51.26 
 
 
1407 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000217058  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  37.16 
 
 
341 aa  93.6  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  37.16 
 
 
341 aa  93.6  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  29.6 
 
 
527 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  32.92 
 
 
427 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  29.59 
 
 
307 aa  87  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  29.59 
 
 
307 aa  87  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  29.59 
 
 
307 aa  87  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  26.8 
 
 
542 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  26.8 
 
 
542 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  26.8 
 
 
542 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11357  PE-PGRS family protein  53.66 
 
 
603 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0271727  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12540  PE family protein  51.67 
 
 
492 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000611241  hitchhiker  0.0026092 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13114  hypothetical protein  46.88 
 
 
437 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.773081 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11469  PE-PGRS family protein  51.94 
 
 
491 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0503304  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13623  PE-PGRS family protein  53.54 
 
 
584 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.91824e-18  normal  0.0516609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12611  PE-PGRS family protein  51.88 
 
 
543 aa  80.1  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0987331  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10849  PE-PGRS family protein  53.85 
 
 
879 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.4370299999999996e-27  hitchhiker  0.00000147431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  48 
 
 
457 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12634  PE-PGRS family protein  48 
 
 
461 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000268791  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13545  PE-PGRS family protein  45.6 
 
 
1888 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000435663  hitchhiker  0.000141751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  31.02 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11834  PE-PGRS family protein  42.97 
 
 
650 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00239965  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11848  PE-PGRS family protein  55.56 
 
 
518 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.114393  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12351  PE family protein  46.09 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12192  PE-PGRS family protein  51.09 
 
 
532 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9578499999999997e-20  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13378  PE-PGRS family protein  54.33 
 
 
1570 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.793451  normal  0.887646 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10110  PE-PGRS family protein  46.97 
 
 
533 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1238  hypothetical protein  27.36 
 
 
518 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13628  PE-PGRS family protein  48.8 
 
 
439 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000236295  normal  0.0644121 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  27.23 
 
 
458 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12754  PE-PGRS family protein  48.8 
 
 
565 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000417196  normal  0.0386161 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11269  PE-PGRS family protein  53.04 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119088  hitchhiker  0.00152162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  28.99 
 
 
494 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  27.45 
 
 
768 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13846  PE-PGRS family protein  52.04 
 
 
504 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200621  normal  0.262827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11669  PE-PGRS family protein  48 
 
 
549 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.43838e-17  normal  0.300456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13422  PE-PGRS family protein  44.8 
 
 
731 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000255336  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11085  PE-PGRS family protein  48.46 
 
 
667 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.21525e-28  normal  0.25323 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  28.5 
 
 
410 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11197  PE family protein  48.15 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11663  PE family protein  42.97 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11105  PE-PGRS family protein  48.82 
 
 
779 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.19894e-57  normal  0.745031 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12653  PE-PGRS family protein  48.41 
 
 
788 aa  70.1  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000028408  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12424  PE-PGRS family protein  45.67 
 
 
382 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.712465  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13403  PE-PGRS family protein  47.67 
 
 
591 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000216419  normal  0.654566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10847  PE-PGRS family protein  50.41 
 
 
137 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.4239e-69  hitchhiker  0.000000132499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13547  PE-PGRS family protein  45.97 
 
 
1086 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.98986e-36  hitchhiker  0.0000786536 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12364  PE-PGRS family protein  54.32 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  27.76 
 
 
401 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  29.15 
 
 
411 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  30.29 
 
 
391 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5244  hypothetical protein  32.27 
 
 
433 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13542  PE-PGRS family protein  46.96 
 
 
2332 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000034434  hitchhiker  0.00332748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2068  hypothetical protein  27.73 
 
 
432 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183001  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10588  PE-PGRS family protein  46.03 
 
 
1306 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00297042  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  28.14 
 
 
404 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10996  PE-PGRS family protein  46.22 
 
 
313 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7191000000000003e-35  normal  0.547752 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11496  PE-PGRS family protein  46.4 
 
 
375 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000634061  normal  0.0755488 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10304  PE-PGRS family protein  49.21 
 
 
622 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0360601  normal  0.165119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11425  PE-PGRS family protein  50.41 
 
 
576 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000100458  normal  0.0951709 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13512  PE family protein  43.18 
 
 
98 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.951509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  25.37 
 
 
423 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10125  PE-PGRS family protein  50.41 
 
 
561 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000011228  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11112  PE-PGRS family protein  49.61 
 
 
853 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336586  normal  0.286221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11818  PE family protein  50.57 
 
 
99 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.850225  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  25.51 
 
 
421 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12509  PE-PGRS family protein  50.4 
 
 
431 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.90533e-20  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10340  PE family protein  44.16 
 
 
171 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11194  PE family protein  34.34 
 
 
106 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11783  PE-PGRS family protein  46.83 
 
 
911 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.68379e-22  hitchhiker  0.0000000263323 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11821  PE family protein  50.57 
 
 
105 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.784266  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>