74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0786 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0786  peptidase S15  100 
 
 		 562 aa  1141    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.781394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  35.96 
 
 		 497 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0746  hypothetical protein  34.63 
 
 		 532 aa  263  6e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3626  hydrolase CocE/NonD family protein  33.67 
 
 		 561 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  31.88 
 
 		 524 aa  213  7e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0776  peptidase S15  33.87 
 
 		 517 aa  206  9e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1243  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.79 
 
 		 572 aa  190  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1556  CocE/NonD family hydrolase  29.94 
 
 		 572 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1638  CocE/NonD family hydrolase  29.94 
 
 		 567 aa  190  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1557  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  30.86 
 
 		 557 aa  189  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0130  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  29.73 
 
 		 572 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04393  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  47.06 
 
 		 218 aa  98.6  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.890391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  25.19 
 
 		 866 aa  73.9  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  33.77 
 
 		 876 aa  73.6  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  25.05 
 
 		 897 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  38.56 
 
 		 1010 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4056  peptidase S15  24.64 
 
 		 655 aa  68.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  36.27 
 
 		 868 aa  67  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  22.89 
 
 		 678 aa  59.3  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.1 
 
 		 944 aa  59.3  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0347  peptidase S15  22.61 
 
 		 686 aa  55.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04392  hypothetical protein  35.9 
 
 		 109 aa  54.7  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4797  peptidase S15  24.18 
 
 		 494 aa  54.7  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0778  ABC transporter related protein  35.64 
 
 		 976 aa  54.3  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11864  hypothetical protein  22.64 
 
 		 628 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.488629  normal  0.930954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  27.78 
 
 		 968 aa  53.9  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3229  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  28.31 
 
 		 656 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16048  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0574  peptidase S15  32.04 
 
 		 556 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  30.47 
 
 		 298 aa  52  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  21.63 
 
 		 668 aa  52  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2538  peptidase S15  27.67 
 
 		 887 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  26.69 
 
 		 814 aa  50.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5138  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  27.85 
 
 		 656 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1067  peptidase S15  23.08 
 
 		 775 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1041  peptidase S15  22.66 
 
 		 778 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  28.57 
 
 		 286 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 		 286 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8686  peptidase S15  26.4 
 
 		 529 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0100  hypothetical protein  31.58 
 
 		 656 aa  47.8  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.338515  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  27.93 
 
 		 299 aa  48.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4832  peptidase S15  24.7 
 
 		 679 aa  47.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  32 
 
 		 650 aa  47  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  23.74 
 
 		 306 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  32.89 
 
 		 318 aa  46.6  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  32.61 
 
 		 309 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  34.19 
 
 		 297 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4077  peptidase S15  32.67 
 
 		 854 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25820  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  36 
 
 		 648 aa  46.2  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  33.65 
 
 		 296 aa  46.2  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1796  peptidase S15  26.14 
 
 		 569 aa  46.2  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  26.71 
 
 		 309 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.03 
 
 		 550 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  30.89 
 
 		 326 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.78 
 
 		 561 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  27.21 
 
 		 316 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4532  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  27.4 
 
 		 651 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0380  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  26.64 
 
 		 725 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.871447  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5057  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  27.4 
 
 		 651 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 		 295 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.58 
 
 		 617 aa  45.1  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5229  peptidase S15  22.32 
 
 		 806 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.649793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0505  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  27.73 
 
 		 651 aa  44.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  30.57 
 
 		 577 aa  44.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  30.68 
 
 		 295 aa  44.3  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5192  peptidase S15  31.91 
 
 		 813 aa  44.3  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  22.5 
 
 		 553 aa  44.3  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  21.86 
 
 		 677 aa  43.9  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0146  putative signal peptide protein  29.82 
 
 		 298 aa  43.9  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1938  hydrolase CocE/NonD family protein  23.2 
 
 		 644 aa  44.3  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3347  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  22.9 
 
 		 570 aa  44.3  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  25.54 
 
 		 372 aa  43.9  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  30.33 
 
 		 315 aa  43.9  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  25.78 
 
 		 309 aa  43.9  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  31.46 
 
 		 292 aa  43.5  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>