35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2389 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2389  hypothetical protein  100 
 
 
507 aa  1011    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.573673  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2391  Fibronectin type III domain protein  84.25 
 
 
748 aa  249  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.999424  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  74.66 
 
 
703 aa  228  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  71.14 
 
 
1004 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  70.34 
 
 
984 aa  212  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  65.79 
 
 
1050 aa  199  7e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  64.88 
 
 
1221 aa  197  3e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  55.56 
 
 
651 aa  149  9e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2400  hypothetical protein  53.52 
 
 
611 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.150385  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  51.72 
 
 
453 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  37.21 
 
 
433 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0234  hypothetical protein  35.63 
 
 
128 aa  50.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000287276  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  48.28 
 
 
771 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  37.63 
 
 
830 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  47.27 
 
 
338 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  41.46 
 
 
846 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  41.46 
 
 
356 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  39 
 
 
455 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  54.24 
 
 
605 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  38.16 
 
 
914 aa  47  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1679  hypothetical protein  40 
 
 
746 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.548222  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30179  hypothetical protein  53.97 
 
 
617 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  26.55 
 
 
393 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  38.24 
 
 
1281 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  26.77 
 
 
460 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  56.41 
 
 
628 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  23.35 
 
 
709 aa  44.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  38.95 
 
 
1394 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  35.48 
 
 
329 aa  43.9  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  29.81 
 
 
904 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  36.27 
 
 
625 aa  43.9  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  35.23 
 
 
916 aa  43.9  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  23.48 
 
 
391 aa  43.5  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  37.68 
 
 
551 aa  43.5  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  43.55 
 
 
449 aa  43.5  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>