22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1702 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1702  Carbohydrate-binding CenC domain protein  100 
 
 
224 aa  460  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  41.46 
 
 
1037 aa  151  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  50.33 
 
 
1059 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  50.33 
 
 
1059 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  40.14 
 
 
1041 aa  122  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  33.66 
 
 
1020 aa  116  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.15 
 
 
697 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  31.34 
 
 
639 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 
1018 aa  83.6  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  36.67 
 
 
955 aa  82  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  29.87 
 
 
1019 aa  75.9  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 
619 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  30.97 
 
 
912 aa  65.1  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  27.36 
 
 
1050 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  28.74 
 
 
756 aa  63.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  30.86 
 
 
1780 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  23.86 
 
 
1077 aa  53.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25.37 
 
 
1146 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  25.16 
 
 
1331 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  29.5 
 
 
690 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  25.37 
 
 
712 aa  43.5  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  22.22 
 
 
689 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>